More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0529 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
1266 aa  2603    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 
1621 aa  546  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 
1544 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
1448 aa  416  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  38.07 
 
 
782 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  37.12 
 
 
985 aa  360  7e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 
1060 aa  333  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.54 
 
 
991 aa  301  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 
1313 aa  265  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  35.4 
 
 
725 aa  249  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  25.57 
 
 
1219 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 
1450 aa  220  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  38.36 
 
 
828 aa  219  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  30 
 
 
2145 aa  217  9.999999999999999e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  30.39 
 
 
941 aa  211  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
1711 aa  201  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 
1779 aa  199  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  29.08 
 
 
1550 aa  199  4.0000000000000005e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 
412 aa  196  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 
1162 aa  195  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.65 
 
 
1162 aa  195  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 
1247 aa  193  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
1261 aa  188  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 
1101 aa  188  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  22.12 
 
 
957 aa  185  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.11 
 
 
1186 aa  181  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  32.58 
 
 
1238 aa  180  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  22.35 
 
 
1914 aa  179  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  28.74 
 
 
1009 aa  177  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 
343 aa  177  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
408 aa  171  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
1596 aa  165  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  30.1 
 
 
340 aa  164  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 
1526 aa  163  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 
1063 aa  152  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 
1025 aa  151  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 
923 aa  148  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.88 
 
 
1279 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  38.06 
 
 
689 aa  147  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  30.77 
 
 
364 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  21.14 
 
 
1714 aa  140  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.44 
 
 
1404 aa  140  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.08 
 
 
609 aa  138  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.81 
 
 
2741 aa  137  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.12 
 
 
2741 aa  136  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.1 
 
 
636 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
568 aa  134  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.88 
 
 
568 aa  134  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
454 aa  132  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  30.27 
 
 
809 aa  133  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  30.14 
 
 
825 aa  131  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
878 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  25.32 
 
 
1020 aa  129  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 
994 aa  127  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 
1215 aa  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 
649 aa  125  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  30.53 
 
 
357 aa  125  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.04 
 
 
810 aa  125  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 
916 aa  124  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  30.31 
 
 
1040 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
438 aa  122  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
760 aa  121  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  28.83 
 
 
493 aa  119  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  29.17 
 
 
1228 aa  119  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  24.72 
 
 
1007 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
543 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.92 
 
 
1694 aa  117  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  24.68 
 
 
1048 aa  116  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.1 
 
 
740 aa  116  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  28.4 
 
 
919 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  26.98 
 
 
981 aa  113  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.57 
 
 
1291 aa  112  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.88 
 
 
1328 aa  112  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 
949 aa  112  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  28.71 
 
 
1212 aa  110  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.63 
 
 
1056 aa  109  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.91 
 
 
771 aa  109  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  27.54 
 
 
834 aa  109  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 
843 aa  108  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.81 
 
 
758 aa  107  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.53 
 
 
1288 aa  105  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  21.45 
 
 
1180 aa  105  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.4 
 
 
784 aa  105  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.08 
 
 
787 aa  104  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.02 
 
 
560 aa  104  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.83 
 
 
971 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  27.06 
 
 
1044 aa  103  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.77 
 
 
1056 aa  102  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.69 
 
 
732 aa  102  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 
1298 aa  102  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.41 
 
 
988 aa  102  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  24.92 
 
 
1025 aa  101  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  29.55 
 
 
1054 aa  101  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.25 
 
 
1039 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.89 
 
 
852 aa  99.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  26.2 
 
 
992 aa  99.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0621  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
368 aa  99.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.99 
 
 
885 aa  99.4  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  25.6 
 
 
755 aa  99.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  28.85 
 
 
1021 aa  98.2  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>