More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0458 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  100 
 
 		 941 aa  1851    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  40.6 
 
 		 782 aa  331  5.0000000000000004e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 1450 aa  293  8e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  36.83 
 
 		 985 aa  267  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.41 
 
 		 962 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 1526 aa  228  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 907 aa  225  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1060 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  30.39 
 
 		 834 aa  221  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  30.4 
 
 		 827 aa  221  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.38 
 
 		 991 aa  217  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 1313 aa  217  8e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  29.75 
 
 		 981 aa  213  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 850 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  30.39 
 
 		 1266 aa  211  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  28.96 
 
 		 941 aa  211  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.46 
 
 		 971 aa  208  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  30.07 
 
 		 1021 aa  204  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 1596 aa  204  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  31.63 
 
 		 946 aa  203  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1238 aa  197  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  31.57 
 
 		 775 aa  197  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  28.38 
 
 		 788 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  28.23 
 
 		 1020 aa  190  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  29.18 
 
 		 797 aa  186  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  30.8 
 
 		 1088 aa  185  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.01 
 
 		 996 aa  185  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  29.93 
 
 		 1108 aa  185  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  28.33 
 
 		 919 aa  184  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  28.61 
 
 		 992 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  31.56 
 
 		 814 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  29.38 
 
 		 913 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 1048 aa  181  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  30.74 
 
 		 993 aa  178  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  29.16 
 
 		 964 aa  177  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  29.41 
 
 		 908 aa  176  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 1071 aa  174  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  29.05 
 
 		 790 aa  173  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  29.24 
 
 		 1008 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  28.11 
 
 		 1022 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  29.13 
 
 		 970 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.39 
 
 		 636 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 792 aa  171  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.59 
 
 		 1279 aa  171  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  29.97 
 
 		 792 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  30.57 
 
 		 915 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  27.12 
 
 		 967 aa  168  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  27.84 
 
 		 741 aa  168  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  31.29 
 
 		 1013 aa  168  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  29.6 
 
 		 965 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  30.23 
 
 		 931 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  29.89 
 
 		 928 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  28.62 
 
 		 1054 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  33.03 
 
 		 838 aa  165  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  28.28 
 
 		 990 aa  164  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.38 
 
 		 742 aa  164  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 755 aa  163  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  28.44 
 
 		 934 aa  162  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.81 
 
 		 957 aa  162  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  29.02 
 
 		 956 aa  159  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  26.41 
 
 		 992 aa  158  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  26.41 
 
 		 1017 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  29.09 
 
 		 1030 aa  156  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  28.44 
 
 		 981 aa  155  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  30 
 
 		 715 aa  153  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  30.93 
 
 		 940 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  29.76 
 
 		 950 aa  153  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  36.56 
 
 		 1014 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  28.43 
 
 		 1003 aa  152  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  29.56 
 
 		 770 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  36.68 
 
 		 1034 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  29.55 
 
 		 1022 aa  148  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  27.69 
 
 		 806 aa  147  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  29.03 
 
 		 935 aa  147  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  26.41 
 
 		 978 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  29.05 
 
 		 930 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  29.32 
 
 		 2145 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 1138 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  37.93 
 
 		 1033 aa  142  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1805  putative regulator protein  30.67 
 
 		 708 aa  141  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  25.98 
 
 		 783 aa  141  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  35.86 
 
 		 1003 aa  140  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  27.21 
 
 		 937 aa  140  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.3 
 
 		 921 aa  138  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 1101 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.59 
 
 		 989 aa  137  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 1261 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 		 896 aa  136  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  34.85 
 
 		 995 aa  135  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  34.7 
 
 		 1027 aa  134  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  27.79 
 
 		 954 aa  134  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  33.16 
 
 		 907 aa  134  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  26.55 
 
 		 1025 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  36.24 
 
 		 1030 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  28.59 
 
 		 921 aa  132  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  28.55 
 
 		 965 aa  132  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  26.83 
 
 		 993 aa  131  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  29.71 
 
 		 1024 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  31.14 
 
 		 982 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  27.57 
 
 		 828 aa  129  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>