More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5833 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 937 aa  1829    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  37.63 
 
 		 970 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  36.2 
 
 		 993 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  37.46 
 
 		 919 aa  462  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 956 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  36.13 
 
 		 928 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  37.06 
 
 		 965 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 		 908 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  33.58 
 
 		 946 aa  418  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  35.17 
 
 		 941 aa  405  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  35.53 
 
 		 921 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  33.83 
 
 		 967 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36.45 
 
 		 931 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.12 
 
 		 930 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  33.75 
 
 		 1088 aa  348  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  32.54 
 
 		 981 aa  340  8e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  34.05 
 
 		 1020 aa  336  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.93 
 
 		 921 aa  328  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.76 
 
 		 1025 aa  320  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  33.82 
 
 		 940 aa  320  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 1048 aa  320  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.45 
 
 		 996 aa  317  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.7 
 
 		 990 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  31.22 
 
 		 907 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 962 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  32.76 
 
 		 928 aa  310  6.999999999999999e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  31.05 
 
 		 1027 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.2 
 
 		 1022 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  32.82 
 
 		 992 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 934 aa  298  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 965 aa  295  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.57 
 
 		 964 aa  295  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 1071 aa  292  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  33.97 
 
 		 1054 aa  291  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30.36 
 
 		 1017 aa  291  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  33.11 
 
 		 950 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  31.95 
 
 		 992 aa  285  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  35.7 
 
 		 814 aa  281  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.23 
 
 		 1108 aa  281  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  37.79 
 
 		 1010 aa  280  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  32.9 
 
 		 935 aa  279  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  37.44 
 
 		 1034 aa  278  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  32.27 
 
 		 971 aa  277  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  34.31 
 
 		 1008 aa  277  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  34.21 
 
 		 990 aa  277  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  30.11 
 
 		 1011 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  32.18 
 
 		 1021 aa  276  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  33.96 
 
 		 1014 aa  276  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  31.37 
 
 		 913 aa  274  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.87 
 
 		 915 aa  271  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  33.23 
 
 		 806 aa  269  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  32.49 
 
 		 994 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.14 
 
 		 983 aa  267  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  33.01 
 
 		 1022 aa  266  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  35.81 
 
 		 1003 aa  266  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  42.47 
 
 		 496 aa  264  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  31.2 
 
 		 1013 aa  263  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  35.46 
 
 		 1030 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  34.89 
 
 		 995 aa  263  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  34.96 
 
 		 1004 aa  260  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 		 850 aa  257  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  31.55 
 
 		 1003 aa  255  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  31.86 
 
 		 1025 aa  254  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  35.6 
 
 		 790 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  31.33 
 
 		 993 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  31.4 
 
 		 1138 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  30.92 
 
 		 954 aa  251  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  32.7 
 
 		 788 aa  251  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  34.65 
 
 		 838 aa  249  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.93 
 
 		 742 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  35.36 
 
 		 775 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.16 
 
 		 1033 aa  246  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  33.12 
 
 		 621 aa  244  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  34.19 
 
 		 1024 aa  241  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  37.03 
 
 		 632 aa  241  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.21 
 
 		 989 aa  241  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 654 aa  237  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  35.91 
 
 		 963 aa  234  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 757 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  29.11 
 
 		 981 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  29.63 
 
 		 982 aa  231  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  36.83 
 
 		 1001 aa  226  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  31.74 
 
 		 715 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.59 
 
 		 1030 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  30.36 
 
 		 1033 aa  222  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  34.35 
 
 		 687 aa  218  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  31.46 
 
 		 1060 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  34.02 
 
 		 797 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  37.03 
 
 		 453 aa  214  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  32.69 
 
 		 775 aa  214  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  31.91 
 
 		 783 aa  211  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.4 
 
 		 631 aa  210  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 770 aa  210  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 1319 aa  209  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  31.19 
 
 		 792 aa  205  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  32.34 
 
 		 792 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  35.44 
 
 		 582 aa  201  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  33.51 
 
 		 1003 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  32.83 
 
 		 910 aa  200  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>