More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  100 
 
 		 496 aa  964    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  45.33 
 
 		 453 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  40.29 
 
 		 1022 aa  302  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  41.53 
 
 		 1003 aa  299  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  42.68 
 
 		 1030 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  46.17 
 
 		 582 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  45.06 
 
 		 940 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  42.65 
 
 		 1088 aa  289  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  40 
 
 		 990 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  42.13 
 
 		 990 aa  283  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  42.51 
 
 		 954 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  41.01 
 
 		 921 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  40.78 
 
 		 930 aa  277  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  40.34 
 
 		 950 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  39.17 
 
 		 1014 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  39.74 
 
 		 1020 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  40.7 
 
 		 981 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  39.67 
 
 		 1010 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  37.14 
 
 		 995 aa  269  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  36.58 
 
 		 992 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  38.91 
 
 		 931 aa  266  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  41.02 
 
 		 965 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  40.09 
 
 		 1033 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  39.12 
 
 		 996 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 1071 aa  263  6e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  35.22 
 
 		 1108 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  38.56 
 
 		 983 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 654 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  38.75 
 
 		 907 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  39.25 
 
 		 1025 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  39.19 
 
 		 921 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  41.55 
 
 		 937 aa  256  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  39.79 
 
 		 956 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  37.92 
 
 		 1003 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  35.82 
 
 		 621 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  36.6 
 
 		 1027 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  36.33 
 
 		 1017 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  36.95 
 
 		 934 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  39.47 
 
 		 963 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  38.17 
 
 		 1025 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  39.16 
 
 		 919 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  37.45 
 
 		 964 aa  237  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  37.75 
 
 		 1054 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  36.52 
 
 		 928 aa  236  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  34.48 
 
 		 970 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  37.7 
 
 		 946 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 621 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  36.93 
 
 		 967 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  34.85 
 
 		 993 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  36.19 
 
 		 992 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  40.38 
 
 		 1001 aa  223  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  38.24 
 
 		 1021 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  36.67 
 
 		 928 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  35.69 
 
 		 1022 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  38.48 
 
 		 1138 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  37.7 
 
 		 935 aa  217  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  37.44 
 
 		 1030 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  38.72 
 
 		 989 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  37.36 
 
 		 908 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  35.44 
 
 		 982 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  37.04 
 
 		 1003 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  36.46 
 
 		 981 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  36.06 
 
 		 666 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  36.15 
 
 		 965 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 622 aa  209  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  35.74 
 
 		 775 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1011 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.23 
 
 		 1013 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  38.15 
 
 		 941 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  36.85 
 
 		 971 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 1034 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 1048 aa  204  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  35.97 
 
 		 993 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  41.1 
 
 		 926 aa  202  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  36.89 
 
 		 910 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  42.76 
 
 		 378 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  37.58 
 
 		 632 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  35.1 
 
 		 913 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 962 aa  193  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  36.55 
 
 		 1000 aa  193  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  37.24 
 
 		 994 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  36.71 
 
 		 1008 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.74 
 
 		 960 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.88 
 
 		 631 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  37.39 
 
 		 910 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  37.27 
 
 		 915 aa  183  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  38.93 
 
 		 1024 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 268 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  33.68 
 
 		 612 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 1319 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.58 
 
 		 957 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  39.22 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 1346 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  44.09 
 
 		 1339 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  34.91 
 
 		 978 aa  170  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 952 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  34.42 
 
 		 1186 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  48.21 
 
 		 755 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  45.29 
 
 		 788 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  35.01 
 
 		 1092 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>