More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3884 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 990 aa  1959    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  40.94 
 
 		 1014 aa  614  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  40.06 
 
 		 1003 aa  595  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  39.53 
 
 		 1010 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  36.72 
 
 		 1027 aa  559  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  40.5 
 
 		 1033 aa  558  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  37.49 
 
 		 995 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  41.3 
 
 		 1001 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  37.59 
 
 		 1003 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.43 
 
 		 983 aa  436  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  36.97 
 
 		 1030 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 1071 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.02 
 
 		 1025 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.01 
 
 		 1020 aa  366  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  37 
 
 		 1088 aa  360  9e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  32.53 
 
 		 992 aa  354  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.48 
 
 		 996 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.42 
 
 		 1022 aa  342  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.46 
 
 		 931 aa  341  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  39.97 
 
 		 990 aa  340  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.98 
 
 		 921 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  36.02 
 
 		 1108 aa  327  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  32.27 
 
 		 934 aa  326  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  33.09 
 
 		 907 aa  325  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  32.15 
 
 		 981 aa  325  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  38.34 
 
 		 940 aa  323  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.17 
 
 		 913 aa  321  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  31.69 
 
 		 919 aa  317  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  39.27 
 
 		 921 aa  315  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  37.82 
 
 		 1025 aa  315  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  33.09 
 
 		 1022 aa  312  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 1048 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 654 aa  311  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  40.35 
 
 		 954 aa  309  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  37.03 
 
 		 946 aa  306  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  36.95 
 
 		 621 aa  304  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.69 
 
 		 1017 aa  303  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  31.85 
 
 		 928 aa  301  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  37.1 
 
 		 930 aa  300  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 993 aa  295  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  31.2 
 
 		 1011 aa  294  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  33.81 
 
 		 1034 aa  293  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  38.6 
 
 		 963 aa  293  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  33 
 
 		 970 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.06 
 
 		 950 aa  292  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  38.13 
 
 		 941 aa  293  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  34.71 
 
 		 1008 aa  290  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  36.45 
 
 		 956 aa  289  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  32.77 
 
 		 928 aa  287  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  35.9 
 
 		 982 aa  287  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  30.84 
 
 		 1013 aa  285  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 1054 aa  283  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  35.43 
 
 		 992 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  36.24 
 
 		 1003 aa  281  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  33.25 
 
 		 915 aa  280  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  37.54 
 
 		 935 aa  278  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  41.6 
 
 		 496 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  37.25 
 
 		 989 aa  275  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  36.1 
 
 		 964 aa  273  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  41.88 
 
 		 453 aa  269  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  34.79 
 
 		 967 aa  269  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 1021 aa  268  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  36.15 
 
 		 775 aa  268  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  29.96 
 
 		 981 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  37.3 
 
 		 926 aa  263  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  34.59 
 
 		 908 aa  261  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  36.13 
 
 		 962 aa  260  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  35.82 
 
 		 965 aa  260  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  37.98 
 
 		 965 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  37.64 
 
 		 910 aa  259  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  36.41 
 
 		 1138 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  36.69 
 
 		 971 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 1319 aa  256  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  42.23 
 
 		 788 aa  253  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  37.84 
 
 		 915 aa  250  9e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  37.24 
 
 		 582 aa  249  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  35.64 
 
 		 612 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  35.35 
 
 		 1030 aa  245  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 850 aa  241  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  31.53 
 
 		 790 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  32.03 
 
 		 910 aa  236  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  35.99 
 
 		 632 aa  235  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  36.09 
 
 		 1024 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  32.73 
 
 		 937 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 1346 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 		 806 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  39.39 
 
 		 797 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  34.21 
 
 		 715 aa  221  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  34.91 
 
 		 666 aa  221  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  32.07 
 
 		 978 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 621 aa  218  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  41.32 
 
 		 814 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  34.12 
 
 		 792 aa  212  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  38.34 
 
 		 993 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 622 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.97 
 
 		 631 aa  204  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  40.05 
 
 		 755 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  41.52 
 
 		 370 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  37.97 
 
 		 994 aa  197  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  30.79 
 
 		 1004 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>