More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3801 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 993 aa  1971    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  49.38 
 
 		 982 aa  755    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  38.14 
 
 		 1025 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  31.83 
 
 		 919 aa  359  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 1071 aa  352  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.62 
 
 		 967 aa  351  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.02 
 
 		 1020 aa  350  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.58 
 
 		 964 aa  346  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.5 
 
 		 921 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.42 
 
 		 921 aa  335  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  33.93 
 
 		 741 aa  335  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 981 aa  333  8e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  33.08 
 
 		 928 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 		 930 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 931 aa  331  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  36.67 
 
 		 913 aa  330  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  32.84 
 
 		 1088 aa  322  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  33.71 
 
 		 1008 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 908 aa  311  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  30.91 
 
 		 907 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  33.73 
 
 		 990 aa  310  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  32.48 
 
 		 940 aa  308  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  33.37 
 
 		 941 aa  308  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  30.61 
 
 		 996 aa  306  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  29.63 
 
 		 992 aa  305  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  30.06 
 
 		 1022 aa  303  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 1048 aa  301  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  31.66 
 
 		 970 aa  298  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  35.68 
 
 		 1010 aa  296  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 1030 aa  293  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.55 
 
 		 962 aa  293  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  36.76 
 
 		 1033 aa  293  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  35.58 
 
 		 995 aa  293  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  34.26 
 
 		 956 aa  290  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  29.31 
 
 		 1014 aa  290  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  29.37 
 
 		 965 aa  287  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  29.28 
 
 		 1003 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  33.02 
 
 		 928 aa  283  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.66 
 
 		 965 aa  280  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  36.49 
 
 		 989 aa  277  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.15 
 
 		 1034 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  29.88 
 
 		 946 aa  274  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 915 aa  272  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  26.78 
 
 		 1027 aa  268  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  34.25 
 
 		 1003 aa  268  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.12 
 
 		 934 aa  266  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  29.33 
 
 		 1011 aa  264  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.81 
 
 		 990 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  29.06 
 
 		 1017 aa  259  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.96 
 
 		 983 aa  258  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  30.39 
 
 		 954 aa  257  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  29.5 
 
 		 981 aa  255  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  32.62 
 
 		 950 aa  255  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  28.92 
 
 		 1022 aa  254  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  31.83 
 
 		 1030 aa  249  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  29.45 
 
 		 1013 aa  247  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  29.55 
 
 		 1054 aa  240  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  34.47 
 
 		 1001 aa  238  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 755 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  31.71 
 
 		 963 aa  235  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  32.78 
 
 		 935 aa  234  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  33.33 
 
 		 788 aa  233  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  28.82 
 
 		 992 aa  233  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  32.65 
 
 		 790 aa  232  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  30.93 
 
 		 1003 aa  231  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  34.32 
 
 		 910 aa  230  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  31.59 
 
 		 993 aa  227  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  30.7 
 
 		 937 aa  224  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  32.55 
 
 		 621 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  33.08 
 
 		 715 aa  220  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  32.52 
 
 		 775 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  35.45 
 
 		 453 aa  217  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 654 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  34.37 
 
 		 797 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.8 
 
 		 971 aa  215  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.7 
 
 		 496 aa  215  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  33.03 
 
 		 910 aa  213  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  34.4 
 
 		 926 aa  211  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  27.35 
 
 		 1021 aa  208  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 850 aa  202  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 1319 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  30.2 
 
 		 1025 aa  201  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  34.15 
 
 		 1138 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  33.52 
 
 		 838 aa  200  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 952 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  30.15 
 
 		 806 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 1346 aa  197  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  33.5 
 
 		 1004 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  31.13 
 
 		 757 aa  194  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  29.7 
 
 		 994 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 		 612 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  30.79 
 
 		 814 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.45 
 
 		 742 aa  182  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  30.89 
 
 		 690 aa  182  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 622 aa  180  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  34.04 
 
 		 978 aa  177  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 775 aa  177  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  26.82 
 
 		 1033 aa  175  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  32.39 
 
 		 792 aa  175  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  31.12 
 
 		 1108 aa  174  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>