More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0976 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 775 aa  1501    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  40.95 
 
 		 814 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  38.89 
 
 		 919 aa  324  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  36.48 
 
 		 965 aa  309  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  34.99 
 
 		 806 aa  306  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  36.42 
 
 		 930 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  36.46 
 
 		 946 aa  304  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  36.54 
 
 		 928 aa  297  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  37.32 
 
 		 921 aa  291  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  37.56 
 
 		 993 aa  289  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  37.26 
 
 		 915 aa  287  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  38.23 
 
 		 838 aa  286  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  35.69 
 
 		 967 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  37.66 
 
 		 970 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  34.34 
 
 		 1020 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  37.98 
 
 		 931 aa  277  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  36.42 
 
 		 908 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.15 
 
 		 742 aa  273  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 757 aa  272  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 		 907 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  34.68 
 
 		 790 aa  263  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  36.07 
 
 		 956 aa  263  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  34.42 
 
 		 788 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 850 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  35.67 
 
 		 962 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.28 
 
 		 913 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  34.44 
 
 		 797 aa  247  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 934 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  32.63 
 
 		 981 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.1 
 
 		 1017 aa  241  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  33.38 
 
 		 1048 aa  240  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  33.15 
 
 		 1088 aa  240  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 		 1025 aa  240  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  36.15 
 
 		 715 aa  239  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.43 
 
 		 755 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  33.42 
 
 		 792 aa  235  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  34.94 
 
 		 1054 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  32.01 
 
 		 1027 aa  227  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  32.48 
 
 		 783 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  34.49 
 
 		 928 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.59 
 
 		 1071 aa  224  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  33.54 
 
 		 1033 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  34.24 
 
 		 1014 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  31.99 
 
 		 1108 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  34.91 
 
 		 937 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  34.63 
 
 		 995 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  42.24 
 
 		 1030 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  36.66 
 
 		 1013 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  31.73 
 
 		 992 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  35.28 
 
 		 940 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  32.88 
 
 		 941 aa  206  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 1011 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  31.41 
 
 		 741 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  32.55 
 
 		 1004 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.93 
 
 		 921 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.28 
 
 		 996 aa  203  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  32.18 
 
 		 935 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  31.42 
 
 		 941 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  30.61 
 
 		 964 aa  201  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  30.6 
 
 		 1022 aa  200  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  40.23 
 
 		 1003 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  40.34 
 
 		 990 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  31.02 
 
 		 971 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  31.69 
 
 		 1010 aa  195  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 810 aa  195  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  33.24 
 
 		 981 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  31.5 
 
 		 1003 aa  194  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  32.33 
 
 		 1021 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  36.22 
 
 		 978 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  32.49 
 
 		 992 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  31.01 
 
 		 1008 aa  191  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  35.91 
 
 		 687 aa  191  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  39.32 
 
 		 1138 aa  187  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  35.16 
 
 		 775 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32.74 
 
 		 1003 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  32.1 
 
 		 993 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  32.48 
 
 		 1022 aa  184  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  33.03 
 
 		 982 aa  183  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.23 
 
 		 965 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  41.71 
 
 		 990 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  32.93 
 
 		 1001 aa  180  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1666  transcriptional regulator, XRE family  38.04 
 
 		 462 aa  178  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  33.58 
 
 		 954 aa  177  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  31.06 
 
 		 1025 aa  177  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  31.57 
 
 		 715 aa  174  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 1034 aa  174  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  34.15 
 
 		 690 aa  173  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6871  hypothetical protein  29.73 
 
 		 854 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.45 
 
 		 950 aa  168  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 654 aa  167  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  38.85 
 
 		 1024 aa  167  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 770 aa  167  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 761 aa  167  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  27.04 
 
 		 834 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.75 
 
 		 632 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  30.53 
 
 		 1030 aa  164  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.45 
 
 		 983 aa  164  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  32.68 
 
 		 910 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  39.77 
 
 		 612 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  37.28 
 
 		 963 aa  160  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>