More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5355 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1138 aa  2223    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  39.91 
 
 		 1003 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  38.26 
 
 		 990 aa  459  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  36.15 
 
 		 992 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  33.79 
 
 		 1022 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  47.64 
 
 		 1024 aa  359  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  40.37 
 
 		 1108 aa  354  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  45.89 
 
 		 963 aa  353  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.05 
 
 		 934 aa  331  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.65 
 
 		 1021 aa  313  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.56 
 
 		 996 aa  313  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  40.33 
 
 		 1025 aa  308  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 654 aa  305  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.67 
 
 		 1088 aa  304  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  36.8 
 
 		 1017 aa  301  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 971 aa  300  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  38.12 
 
 		 981 aa  299  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  43.18 
 
 		 950 aa  298  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  39.58 
 
 		 775 aa  291  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  32.77 
 
 		 1008 aa  290  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  39.58 
 
 		 1010 aa  289  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  37.01 
 
 		 621 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  41.28 
 
 		 632 aa  287  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.51 
 
 		 1025 aa  283  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  31.41 
 
 		 992 aa  282  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  39.31 
 
 		 954 aa  283  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  33.37 
 
 		 993 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  34.41 
 
 		 1022 aa  280  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  30.02 
 
 		 1071 aa  279  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  39.81 
 
 		 1030 aa  277  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  37.25 
 
 		 964 aa  276  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  31.75 
 
 		 913 aa  276  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  32.39 
 
 		 941 aa  275  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  37.14 
 
 		 1014 aa  275  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 935 aa  273  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  32.94 
 
 		 940 aa  272  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  33.8 
 
 		 1013 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.59 
 
 		 965 aa  266  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  32.51 
 
 		 931 aa  262  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  36.3 
 
 		 995 aa  262  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.05 
 
 		 1020 aa  261  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.41 
 
 		 921 aa  261  7e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  36.41 
 
 		 990 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.98 
 
 		 919 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  36.96 
 
 		 962 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  29.22 
 
 		 967 aa  255  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  30.49 
 
 		 956 aa  255  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  32.15 
 
 		 970 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 1346 aa  251  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  28.27 
 
 		 1027 aa  248  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  41.67 
 
 		 612 aa  247  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  32.02 
 
 		 928 aa  247  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  36.72 
 
 		 1033 aa  247  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 1048 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 1319 aa  245  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  32.51 
 
 		 1034 aa  243  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.28 
 
 		 930 aa  241  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  31.31 
 
 		 965 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 850 aa  237  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  37.18 
 
 		 666 aa  237  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  35.02 
 
 		 907 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.43 
 
 		 983 aa  231  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  33.05 
 
 		 797 aa  231  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  33.61 
 
 		 946 aa  226  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 1003 aa  225  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  37.32 
 
 		 1001 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  31.66 
 
 		 910 aa  218  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  40.16 
 
 		 453 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.44 
 
 		 496 aa  216  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  39.08 
 
 		 910 aa  216  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  30.26 
 
 		 928 aa  216  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  33.07 
 
 		 1011 aa  215  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  32.91 
 
 		 981 aa  213  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  30.38 
 
 		 788 aa  212  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  30.46 
 
 		 921 aa  212  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  31.33 
 
 		 908 aa  212  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  37.92 
 
 		 783 aa  211  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  34.61 
 
 		 1003 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  31.2 
 
 		 715 aa  206  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.49 
 
 		 1030 aa  204  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  36.13 
 
 		 1054 aa  203  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 806 aa  203  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  31.56 
 
 		 792 aa  203  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  40.57 
 
 		 761 aa  202  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  36.45 
 
 		 582 aa  201  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  32.76 
 
 		 937 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  35.7 
 
 		 994 aa  200  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  29.56 
 
 		 790 aa  198  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  33.83 
 
 		 989 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6871  hypothetical protein  30.47 
 
 		 854 aa  196  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  34.9 
 
 		 926 aa  195  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  41.8 
 
 		 680 aa  195  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 622 aa  193  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 621 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  31.97 
 
 		 915 aa  187  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  33.01 
 
 		 993 aa  187  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  34.57 
 
 		 915 aa  187  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  30.7 
 
 		 814 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1033 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.31 
 
 		 631 aa  181  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>