More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0601 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 928 aa  1813    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  42.98 
 
 		 930 aa  610  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  43.29 
 
 		 921 aa  555  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  39.85 
 
 		 907 aa  545  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  38 
 
 		 967 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  42.81 
 
 		 806 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  42.45 
 
 		 814 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  39.93 
 
 		 964 aa  452  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  36.11 
 
 		 965 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  34.67 
 
 		 919 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  33.73 
 
 		 946 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  35.1 
 
 		 970 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  35.94 
 
 		 928 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36.05 
 
 		 931 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  35.46 
 
 		 908 aa  360  9e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 757 aa  358  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  38.59 
 
 		 838 aa  358  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.34 
 
 		 742 aa  352  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  35.17 
 
 		 1025 aa  346  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 956 aa  341  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  32.57 
 
 		 993 aa  334  6e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  34.05 
 
 		 1008 aa  332  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.11 
 
 		 1088 aa  328  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  34.65 
 
 		 940 aa  326  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  33.96 
 
 		 941 aa  323  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  32.63 
 
 		 934 aa  318  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.23 
 
 		 981 aa  318  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 1071 aa  316  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  31.09 
 
 		 1027 aa  313  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.36 
 
 		 996 aa  310  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  37.48 
 
 		 995 aa  304  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  32.34 
 
 		 913 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  37.67 
 
 		 1014 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  36.73 
 
 		 993 aa  301  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  30.76 
 
 		 1020 aa  300  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  30.74 
 
 		 1022 aa  298  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  37.61 
 
 		 1010 aa  296  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.29 
 
 		 990 aa  295  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 1048 aa  292  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.44 
 
 		 965 aa  291  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  37.44 
 
 		 982 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  33.21 
 
 		 990 aa  291  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  37.08 
 
 		 775 aa  290  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.6 
 
 		 921 aa  288  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.18 
 
 		 962 aa  287  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 		 1033 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  40.47 
 
 		 1001 aa  283  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  36.51 
 
 		 1003 aa  278  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30.11 
 
 		 1017 aa  278  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  34.34 
 
 		 926 aa  271  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  31.16 
 
 		 937 aa  270  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  34.83 
 
 		 788 aa  270  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  29.21 
 
 		 1108 aa  270  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  33.47 
 
 		 978 aa  270  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  35.75 
 
 		 1030 aa  265  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 1003 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  33.62 
 
 		 790 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  34.07 
 
 		 935 aa  261  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  32.03 
 
 		 981 aa  261  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.16 
 
 		 983 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  31.29 
 
 		 1011 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  31.03 
 
 		 992 aa  258  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.22 
 
 		 1034 aa  258  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 		 1054 aa  258  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  36.28 
 
 		 687 aa  256  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  29.35 
 
 		 1022 aa  254  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  31.45 
 
 		 1003 aa  250  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  36.36 
 
 		 1138 aa  247  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  34.62 
 
 		 715 aa  243  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  32.16 
 
 		 954 aa  242  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.13 
 
 		 1030 aa  241  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  35.89 
 
 		 915 aa  241  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.03 
 
 		 989 aa  240  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.44 
 
 		 950 aa  238  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  37.29 
 
 		 910 aa  238  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 850 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  29.94 
 
 		 992 aa  236  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.38 
 
 		 755 aa  235  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  35.93 
 
 		 963 aa  231  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  33.81 
 
 		 1004 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  31.14 
 
 		 1013 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  29.25 
 
 		 1021 aa  228  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  32.75 
 
 		 1025 aa  227  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  31.68 
 
 		 797 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 654 aa  225  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34.7 
 
 		 621 aa  224  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  35.61 
 
 		 915 aa  222  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.13 
 
 		 971 aa  221  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.67 
 
 		 496 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 1319 aa  214  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  36.55 
 
 		 910 aa  213  9e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  31.16 
 
 		 783 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  36.73 
 
 		 1024 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  32.39 
 
 		 792 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 1346 aa  201  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 622 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  33.84 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  27.85 
 
 		 1060 aa  193  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  32.95 
 
 		 632 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  34.83 
 
 		 775 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>