More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3657 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1030 aa  1996    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  38.6 
 
 		 1025 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  38.79 
 
 		 1088 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 1071 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  37.12 
 
 		 990 aa  438  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  43.53 
 
 		 1010 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  44.21 
 
 		 1014 aa  426  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  35.05 
 
 		 1003 aa  418  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  35.21 
 
 		 1022 aa  416  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  40.95 
 
 		 995 aa  416  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  35.52 
 
 		 1020 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  39.93 
 
 		 915 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  36.83 
 
 		 1054 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  40 
 
 		 1027 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.85 
 
 		 934 aa  399  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  35.14 
 
 		 1108 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  33.43 
 
 		 996 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.97 
 
 		 981 aa  393  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  37.99 
 
 		 940 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  35.28 
 
 		 992 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.98 
 
 		 1033 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.02 
 
 		 921 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  35.91 
 
 		 931 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  35.68 
 
 		 946 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 1048 aa  365  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  40.1 
 
 		 983 aa  363  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  34.38 
 
 		 919 aa  361  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  32.9 
 
 		 1017 aa  360  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  36.18 
 
 		 956 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 		 941 aa  350  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  35.19 
 
 		 965 aa  345  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.88 
 
 		 913 aa  345  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  35.44 
 
 		 1003 aa  344  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.94 
 
 		 921 aa  342  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  34.39 
 
 		 990 aa  341  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  41.89 
 
 		 1001 aa  340  8e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  35.41 
 
 		 954 aa  337  7e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  37.14 
 
 		 950 aa  336  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  40.13 
 
 		 1025 aa  332  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  32.34 
 
 		 1003 aa  330  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  34.79 
 
 		 928 aa  329  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.11 
 
 		 964 aa  327  6e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  32.54 
 
 		 930 aa  324  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  37.42 
 
 		 850 aa  321  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  34.31 
 
 		 970 aa  318  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  39.09 
 
 		 621 aa  316  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  34.12 
 
 		 967 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  35.58 
 
 		 935 aa  314  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  32.22 
 
 		 1022 aa  313  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 654 aa  313  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  35.52 
 
 		 1034 aa  308  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  33.91 
 
 		 962 aa  306  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 989 aa  305  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  42.86 
 
 		 582 aa  303  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 		 1008 aa  302  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  34.87 
 
 		 797 aa  302  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  37.35 
 
 		 965 aa  302  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  36.74 
 
 		 788 aa  301  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  32.12 
 
 		 992 aa  299  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 1319 aa  296  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  33.29 
 
 		 993 aa  295  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  32.39 
 
 		 908 aa  295  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 981 aa  295  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  42.68 
 
 		 496 aa  291  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  31.96 
 
 		 1013 aa  291  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  31.17 
 
 		 1030 aa  289  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  39.58 
 
 		 963 aa  288  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  33.59 
 
 		 907 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  39.85 
 
 		 1138 aa  284  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  33.92 
 
 		 928 aa  280  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  35.17 
 
 		 775 aa  280  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  37.5 
 
 		 790 aa  280  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 1346 aa  280  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  35.93 
 
 		 910 aa  280  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  32.16 
 
 		 1021 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  36.41 
 
 		 1024 aa  273  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  42.36 
 
 		 453 aa  270  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  43.02 
 
 		 926 aa  270  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  37.44 
 
 		 632 aa  268  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  31.26 
 
 		 971 aa  268  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  41.47 
 
 		 915 aa  265  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  38.4 
 
 		 910 aa  261  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  30.36 
 
 		 982 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  34.4 
 
 		 978 aa  251  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  33.75 
 
 		 993 aa  251  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  37 
 
 		 666 aa  249  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  36.61 
 
 		 715 aa  248  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 755 aa  244  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  34.7 
 
 		 1011 aa  240  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  34.62 
 
 		 612 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.3 
 
 		 631 aa  234  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 621 aa  234  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  36.2 
 
 		 775 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 806 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  32.74 
 
 		 937 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  28.53 
 
 		 1033 aa  228  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 757 aa  224  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  38.1 
 
 		 838 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  33.17 
 
 		 1004 aa  221  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 622 aa  219  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>