More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5051 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 965 aa  1911    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  41.6 
 
 		 967 aa  575  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  40 
 
 		 946 aa  572  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  40.36 
 
 		 928 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  38.89 
 
 		 919 aa  537  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  38.77 
 
 		 970 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  37.63 
 
 		 921 aa  505  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  43.04 
 
 		 993 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  37.51 
 
 		 908 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  36.2 
 
 		 928 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  36.77 
 
 		 956 aa  466  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  36.96 
 
 		 941 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  36.6 
 
 		 930 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36.16 
 
 		 931 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  34.08 
 
 		 907 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  35.5 
 
 		 1020 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  36.04 
 
 		 937 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  35.39 
 
 		 1025 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 1071 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  39.36 
 
 		 814 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 		 964 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.84 
 
 		 996 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 1048 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  35.46 
 
 		 1088 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 		 850 aa  379  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 990 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  39.39 
 
 		 838 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 1054 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.78 
 
 		 742 aa  369  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  35.33 
 
 		 1030 aa  365  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  32.33 
 
 		 1022 aa  364  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  35.89 
 
 		 806 aa  350  8e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  32.7 
 
 		 981 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32.79 
 
 		 1003 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  33.16 
 
 		 992 aa  344  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  35.07 
 
 		 940 aa  343  7e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  30.78 
 
 		 1027 aa  342  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  35.58 
 
 		 965 aa  342  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  37.39 
 
 		 788 aa  341  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 915 aa  340  8e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.88 
 
 		 921 aa  334  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.67 
 
 		 950 aa  334  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  31.09 
 
 		 913 aa  333  6e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 995 aa  333  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  32.5 
 
 		 971 aa  332  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.15 
 
 		 1108 aa  331  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  35.95 
 
 		 790 aa  329  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.02 
 
 		 934 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  38.32 
 
 		 1010 aa  325  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  37.64 
 
 		 1014 aa  324  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  31.62 
 
 		 1021 aa  321  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  36.61 
 
 		 715 aa  320  7.999999999999999e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  36.35 
 
 		 775 aa  320  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  31.01 
 
 		 992 aa  317  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  38.39 
 
 		 1033 aa  317  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  30.12 
 
 		 993 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  36.14 
 
 		 990 aa  314  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  33.57 
 
 		 1008 aa  312  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  31.01 
 
 		 1030 aa  311  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.38 
 
 		 962 aa  310  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  34.54 
 
 		 797 aa  310  9e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  29.78 
 
 		 1017 aa  310  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  32.41 
 
 		 1013 aa  309  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 757 aa  308  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  30.38 
 
 		 1011 aa  304  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  31.86 
 
 		 954 aa  302  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  30.81 
 
 		 1025 aa  301  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  38.84 
 
 		 1001 aa  300  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  36.49 
 
 		 1003 aa  298  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 		 755 aa  295  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  29.37 
 
 		 982 aa  295  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 978 aa  289  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  30.34 
 
 		 981 aa  284  7.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  34.08 
 
 		 775 aa  283  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  37.12 
 
 		 963 aa  281  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  30.88 
 
 		 1138 aa  281  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  32.03 
 
 		 1024 aa  279  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.68 
 
 		 983 aa  278  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  35.37 
 
 		 621 aa  278  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  31.81 
 
 		 935 aa  278  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  30.6 
 
 		 1022 aa  278  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  32.46 
 
 		 783 aa  269  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 654 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  29.8 
 
 		 1033 aa  263  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  33.96 
 
 		 792 aa  255  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  34.29 
 
 		 687 aa  254  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  31.32 
 
 		 989 aa  254  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 1346 aa  243  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  32.13 
 
 		 1004 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.76 
 
 		 1034 aa  241  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  33.72 
 
 		 1003 aa  240  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.48 
 
 		 496 aa  239  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  34.68 
 
 		 910 aa  235  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  26.85 
 
 		 1060 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  30.52 
 
 		 741 aa  226  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  37.6 
 
 		 782 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  35.65 
 
 		 582 aa  222  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  32.94 
 
 		 690 aa  221  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  33.28 
 
 		 1319 aa  219  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  29.6 
 
 		 834 aa  213  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>