284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3386 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  100 
 
 		 834 aa  1681    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  45.33 
 
 		 827 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1345  HPr kinase  37.78 
 
 		 473 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  31.01 
 
 		 792 aa  251  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  27.86 
 
 		 783 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  28.77 
 
 		 996 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  30.39 
 
 		 941 aa  212  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  29.02 
 
 		 1020 aa  208  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  29.38 
 
 		 992 aa  204  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  29.73 
 
 		 965 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  28.73 
 
 		 981 aa  197  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 1048 aa  194  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2772  AAA ATPase  32.05 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  28.37 
 
 		 788 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  26.69 
 
 		 919 aa  191  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  29.58 
 
 		 931 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  28.45 
 
 		 962 aa  187  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 		 915 aa  187  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 1071 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  28.74 
 
 		 1108 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  27.91 
 
 		 797 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  28.75 
 
 		 790 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  29.07 
 
 		 934 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  26.78 
 
 		 1022 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  28.86 
 
 		 970 aa  177  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  28.55 
 
 		 913 aa  175  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  28.02 
 
 		 993 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  29.99 
 
 		 908 aa  171  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 850 aa  170  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  28.49 
 
 		 946 aa  169  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  28.48 
 
 		 1008 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  27.14 
 
 		 1017 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  28.1 
 
 		 941 aa  164  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  26.43 
 
 		 1027 aa  161  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  27.82 
 
 		 971 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  29.78 
 
 		 1014 aa  157  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  28.37 
 
 		 956 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  28.23 
 
 		 1013 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  28.03 
 
 		 1088 aa  154  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  26.91 
 
 		 775 aa  154  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  32.11 
 
 		 1010 aa  153  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  27.23 
 
 		 1033 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  28.35 
 
 		 1003 aa  151  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1030 aa  151  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  28.82 
 
 		 1001 aa  151  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  34.64 
 
 		 761 aa  150  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  30 
 
 		 990 aa  148  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  34.83 
 
 		 1003 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.84 
 
 		 990 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  26.73 
 
 		 964 aa  147  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  26.99 
 
 		 1021 aa  147  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  28.14 
 
 		 715 aa  146  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  30.4 
 
 		 1138 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  27.41 
 
 		 1034 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  27.17 
 
 		 967 aa  145  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 755 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.78 
 
 		 940 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  31.31 
 
 		 782 aa  141  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  33.43 
 
 		 1024 aa  140  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  26.75 
 
 		 995 aa  140  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  32.68 
 
 		 921 aa  140  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 		 632 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  34.1 
 
 		 838 aa  138  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.24 
 
 		 930 aa  137  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  28.92 
 
 		 935 aa  137  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  30.06 
 
 		 978 aa  136  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  25.5 
 
 		 1025 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  28.64 
 
 		 814 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  30.57 
 
 		 690 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  33.7 
 
 		 1011 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 907 aa  134  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  30.32 
 
 		 775 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  30.11 
 
 		 1030 aa  134  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  26.93 
 
 		 782 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1805  putative regulator protein  27.99 
 
 		 708 aa  132  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  32.2 
 
 		 928 aa  131  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  33.43 
 
 		 1003 aa  131  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  26.43 
 
 		 792 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  28.38 
 
 		 1004 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  31.78 
 
 		 907 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  25.54 
 
 		 992 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  27.44 
 
 		 928 aa  128  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  26.49 
 
 		 1022 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 1319 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  27.23 
 
 		 810 aa  127  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  32.51 
 
 		 862 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1025 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 963 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  28.9 
 
 		 985 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  26.82 
 
 		 896 aa  124  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  26.93 
 
 		 741 aa  124  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 1313 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  27.39 
 
 		 965 aa  123  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  29.13 
 
 		 806 aa  122  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1238 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.55 
 
 		 981 aa  121  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  31.53 
 
 		 1054 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 		 1526 aa  118  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  35 
 
 		 910 aa  117  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1234  Tetratricopeptide TPR_4  34.06 
 
 		 832 aa  117  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840453  decreased coverage  0.00091605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>