More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3684 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 930 aa  1859    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  42.38 
 
 		 921 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  43 
 
 		 928 aa  600  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  40.9 
 
 		 907 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  43.38 
 
 		 806 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  36.66 
 
 		 919 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 967 aa  429  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  40.9 
 
 		 814 aa  426  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  36.57 
 
 		 908 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  35.86 
 
 		 931 aa  413  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  36.49 
 
 		 965 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 946 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  35 
 
 		 956 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 970 aa  363  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  37.11 
 
 		 757 aa  358  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  33.88 
 
 		 964 aa  351  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  40.27 
 
 		 1010 aa  343  8e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  34.9 
 
 		 928 aa  342  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  37.87 
 
 		 838 aa  340  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  33.11 
 
 		 1025 aa  335  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  31.87 
 
 		 1030 aa  334  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.07 
 
 		 934 aa  330  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  31.55 
 
 		 941 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.24 
 
 		 742 aa  322  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.33 
 
 		 921 aa  320  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  38.72 
 
 		 1014 aa  320  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.64 
 
 		 940 aa  317  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 		 993 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  40 
 
 		 1033 aa  314  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  32.5 
 
 		 937 aa  314  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  40.43 
 
 		 1003 aa  313  9e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.22 
 
 		 981 aa  312  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  30.91 
 
 		 1020 aa  312  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  30.53 
 
 		 1022 aa  311  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  37.52 
 
 		 990 aa  306  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  32.44 
 
 		 992 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  35.19 
 
 		 950 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30.96 
 
 		 1017 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  37.1 
 
 		 990 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  32.33 
 
 		 1030 aa  300  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  33.09 
 
 		 1088 aa  300  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.46 
 
 		 996 aa  299  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.76 
 
 		 965 aa  295  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  33.82 
 
 		 993 aa  295  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  37.87 
 
 		 995 aa  294  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  40.03 
 
 		 1001 aa  293  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 1071 aa  293  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  31.44 
 
 		 982 aa  291  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  32.62 
 
 		 1054 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  33.83 
 
 		 1027 aa  282  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  35.7 
 
 		 775 aa  280  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  36.26 
 
 		 983 aa  278  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  30.2 
 
 		 992 aa  277  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  31.39 
 
 		 1003 aa  276  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 1048 aa  277  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  30.68 
 
 		 1022 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 654 aa  272  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  40.78 
 
 		 496 aa  271  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  35.99 
 
 		 1008 aa  267  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  35.17 
 
 		 790 aa  267  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  36.5 
 
 		 963 aa  263  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.05 
 
 		 962 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  34.35 
 
 		 788 aa  261  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  29.05 
 
 		 1108 aa  260  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  36.12 
 
 		 687 aa  260  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  29.39 
 
 		 913 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  30.93 
 
 		 1013 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  36.14 
 
 		 935 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  28.75 
 
 		 971 aa  255  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.75 
 
 		 1034 aa  254  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  32.18 
 
 		 621 aa  250  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 915 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  31.64 
 
 		 1025 aa  245  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  33.23 
 
 		 797 aa  243  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  34.1 
 
 		 1138 aa  241  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  35.25 
 
 		 1003 aa  241  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 952 aa  238  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  32.26 
 
 		 981 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  28.73 
 
 		 1021 aa  234  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  34.41 
 
 		 926 aa  234  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 		 755 aa  234  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 		 910 aa  234  8.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  30.54 
 
 		 954 aa  232  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  34.87 
 
 		 910 aa  229  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  35.65 
 
 		 582 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  33.99 
 
 		 989 aa  228  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 850 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  38.23 
 
 		 715 aa  224  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 		 453 aa  221  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  33.5 
 
 		 775 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  31.78 
 
 		 1004 aa  217  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  35.5 
 
 		 1024 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  33.5 
 
 		 632 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  29.14 
 
 		 978 aa  213  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  33.65 
 
 		 612 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  37.1 
 
 		 1011 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  30.71 
 
 		 1033 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.43 
 
 		 631 aa  205  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  26.92 
 
 		 1060 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 1319 aa  197  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>