More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2636 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 928 aa  1830    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  40.28 
 
 		 965 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  37.45 
 
 		 946 aa  515  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  36.14 
 
 		 970 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  38.07 
 
 		 919 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  36.36 
 
 		 941 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  35.16 
 
 		 967 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  37.47 
 
 		 1025 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  36.23 
 
 		 908 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  36.08 
 
 		 956 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 1048 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  35.94 
 
 		 928 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.99 
 
 		 921 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  35.85 
 
 		 937 aa  416  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  33.77 
 
 		 931 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  38.73 
 
 		 1088 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  35.07 
 
 		 930 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  39.22 
 
 		 993 aa  396  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  34.75 
 
 		 1020 aa  389  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  33.59 
 
 		 907 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 1071 aa  376  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.84 
 
 		 921 aa  369  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  32.05 
 
 		 981 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  34.66 
 
 		 1030 aa  356  8.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  33.44 
 
 		 992 aa  354  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  38.65 
 
 		 814 aa  351  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.56 
 
 		 913 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  31.95 
 
 		 990 aa  346  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  32.65 
 
 		 934 aa  344  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32.53 
 
 		 1003 aa  340  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  35.3 
 
 		 1054 aa  337  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.48 
 
 		 996 aa  336  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 		 1022 aa  335  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  36.75 
 
 		 788 aa  332  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  39.42 
 
 		 1014 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  33.3 
 
 		 940 aa  327  8.000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  30.76 
 
 		 1027 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  37.04 
 
 		 1010 aa  321  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.77 
 
 		 962 aa  321  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.97 
 
 		 965 aa  317  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  36.66 
 
 		 1003 aa  317  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  36.83 
 
 		 838 aa  315  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  33.41 
 
 		 993 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  29.5 
 
 		 1011 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.48 
 
 		 950 aa  311  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  37.27 
 
 		 989 aa  310  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  38.37 
 
 		 990 aa  309  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  31.22 
 
 		 992 aa  309  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  32.52 
 
 		 1013 aa  304  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  36.78 
 
 		 1033 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30.39 
 
 		 1017 aa  301  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 850 aa  298  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  34.42 
 
 		 806 aa  297  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.34 
 
 		 742 aa  298  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  32.53 
 
 		 797 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  35.04 
 
 		 995 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.6 
 
 		 915 aa  290  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  34.04 
 
 		 790 aa  288  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  31.06 
 
 		 964 aa  288  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  31.81 
 
 		 1008 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  35.5 
 
 		 755 aa  281  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  29.1 
 
 		 1108 aa  281  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  30.34 
 
 		 1021 aa  280  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  32.74 
 
 		 715 aa  280  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  32.25 
 
 		 935 aa  279  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  30.34 
 
 		 971 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  33.14 
 
 		 757 aa  278  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  30.94 
 
 		 981 aa  274  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  33.11 
 
 		 983 aa  273  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  32.99 
 
 		 775 aa  265  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  32.21 
 
 		 982 aa  264  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 1003 aa  264  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  32.65 
 
 		 978 aa  258  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34.1 
 
 		 621 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  30.79 
 
 		 954 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  35.69 
 
 		 963 aa  253  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  36.12 
 
 		 1001 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  34.3 
 
 		 775 aa  252  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  31.47 
 
 		 783 aa  250  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 654 aa  249  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  28.37 
 
 		 1022 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  30.36 
 
 		 994 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 1025 aa  246  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  30.61 
 
 		 1034 aa  244  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  32.11 
 
 		 1024 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.49 
 
 		 496 aa  241  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  29.58 
 
 		 1033 aa  240  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  33.12 
 
 		 792 aa  238  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  34.3 
 
 		 687 aa  233  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  31.21 
 
 		 741 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  36.36 
 
 		 915 aa  228  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  36.46 
 
 		 926 aa  226  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  34.99 
 
 		 1138 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 1319 aa  219  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.13 
 
 		 632 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  31.42 
 
 		 1030 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  31.1 
 
 		 910 aa  217  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  31.19 
 
 		 910 aa  217  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  31.66 
 
 		 690 aa  212  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  34 
 
 		 582 aa  211  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>