More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5472 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 994 aa  1909    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  40.73 
 
 		 992 aa  327  9e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  32.35 
 
 		 1088 aa  306  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  41.42 
 
 		 971 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  41.02 
 
 		 1021 aa  279  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  41.06 
 
 		 950 aa  276  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  29.51 
 
 		 919 aa  272  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  32.09 
 
 		 931 aa  272  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  28.21 
 
 		 1017 aa  269  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.63 
 
 		 921 aa  268  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  36.47 
 
 		 621 aa  267  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  38.3 
 
 		 990 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  37.62 
 
 		 1022 aa  266  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  32.07 
 
 		 940 aa  264  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 654 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 1071 aa  259  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  38.66 
 
 		 1014 aa  257  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  38.13 
 
 		 1025 aa  256  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  37.14 
 
 		 981 aa  255  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  38.42 
 
 		 612 aa  255  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  40.9 
 
 		 992 aa  254  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  37.63 
 
 		 775 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  37.3 
 
 		 934 aa  250  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  29.24 
 
 		 1025 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  27.78 
 
 		 1027 aa  250  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  37.78 
 
 		 1003 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  36.26 
 
 		 1022 aa  248  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  39.33 
 
 		 954 aa  248  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  38.91 
 
 		 1003 aa  247  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  36.23 
 
 		 996 aa  244  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  37.89 
 
 		 941 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  38.41 
 
 		 964 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  36.35 
 
 		 995 aa  241  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  37.6 
 
 		 1010 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  37.95 
 
 		 963 aa  238  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  36.5 
 
 		 946 aa  235  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  36.04 
 
 		 1013 aa  234  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  37.03 
 
 		 989 aa  233  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  40.59 
 
 		 632 aa  231  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  37.97 
 
 		 990 aa  225  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  31.79 
 
 		 926 aa  224  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 622 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  38.14 
 
 		 921 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  36.94 
 
 		 453 aa  222  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.74 
 
 		 965 aa  222  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  35.86 
 
 		 970 aa  221  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  37.66 
 
 		 1030 aa  221  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 666 aa  219  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  40.51 
 
 		 1024 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  34.53 
 
 		 1020 aa  219  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  35.05 
 
 		 962 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  37.01 
 
 		 907 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  30.14 
 
 		 908 aa  214  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  36.4 
 
 		 928 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  34.73 
 
 		 1008 aa  212  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  30.05 
 
 		 993 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.45 
 
 		 496 aa  211  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 1048 aa  211  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  29.95 
 
 		 1034 aa  210  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  36.83 
 
 		 935 aa  210  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  36.92 
 
 		 1033 aa  208  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 1319 aa  205  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  35.55 
 
 		 930 aa  205  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  35.7 
 
 		 1138 aa  205  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  30.4 
 
 		 978 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  34.71 
 
 		 981 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.74 
 
 		 983 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  36.79 
 
 		 1030 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  33.4 
 
 		 928 aa  197  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  38.31 
 
 		 582 aa  197  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  37.73 
 
 		 1001 aa  193  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  38.51 
 
 		 910 aa  192  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 621 aa  191  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  35 
 
 		 1003 aa  191  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.35 
 
 		 967 aa  191  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 		 1054 aa  190  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  29.95 
 
 		 915 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.33 
 
 		 631 aa  188  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  34.4 
 
 		 910 aa  189  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 913 aa  187  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  35.56 
 
 		 965 aa  187  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 850 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  33.4 
 
 		 982 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  36.02 
 
 		 915 aa  180  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  33.72 
 
 		 1093 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  33.27 
 
 		 1346 aa  175  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.12 
 
 		 960 aa  174  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  29 
 
 		 788 aa  173  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  34 
 
 		 957 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  29.22 
 
 		 797 aa  167  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  32.71 
 
 		 1011 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 760 aa  164  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  40.57 
 
 		 1108 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  38.94 
 
 		 378 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  35.18 
 
 		 1058 aa  161  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  29.52 
 
 		 993 aa  161  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  36.92 
 
 		 1186 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  32.77 
 
 		 1100 aa  155  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  33.99 
 
 		 1036 aa  155  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  30.45 
 
 		 1033 aa  154  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>