More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3874 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 935 aa  1831    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  39.92 
 
 		 934 aa  571  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  38.96 
 
 		 981 aa  512  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  34.83 
 
 		 992 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  38.53 
 
 		 964 aa  365  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  33.99 
 
 		 1022 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  38.76 
 
 		 962 aa  357  7.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  36.53 
 
 		 1088 aa  350  8e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  41.44 
 
 		 990 aa  344  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 1071 aa  344  5e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  32.12 
 
 		 1108 aa  334  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  34.6 
 
 		 1008 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.21 
 
 		 1013 aa  331  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.65 
 
 		 950 aa  330  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  33.76 
 
 		 941 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  33.4 
 
 		 956 aa  323  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  40.42 
 
 		 963 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  37.4 
 
 		 1030 aa  322  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.47 
 
 		 996 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  33.8 
 
 		 931 aa  318  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  33.3 
 
 		 993 aa  317  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.97 
 
 		 1025 aa  316  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.52 
 
 		 1020 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  34.15 
 
 		 990 aa  312  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  32.64 
 
 		 946 aa  312  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  32.88 
 
 		 1003 aa  311  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31 
 
 		 1017 aa  311  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  39.46 
 
 		 1010 aa  309  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 921 aa  309  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  35.27 
 
 		 940 aa  305  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.2 
 
 		 919 aa  303  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  32.44 
 
 		 913 aa  302  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 		 928 aa  302  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 654 aa  302  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  33.54 
 
 		 992 aa  301  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  33.55 
 
 		 1025 aa  300  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  38.13 
 
 		 1014 aa  297  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  33.86 
 
 		 926 aa  297  8e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  34.69 
 
 		 910 aa  295  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  37.07 
 
 		 621 aa  296  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  39.19 
 
 		 1138 aa  294  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.24 
 
 		 921 aa  292  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 1048 aa  292  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  36.35 
 
 		 1003 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  37.08 
 
 		 954 aa  291  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  33.2 
 
 		 1022 aa  290  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  31.48 
 
 		 930 aa  288  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  35.81 
 
 		 915 aa  287  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 1319 aa  287  5.999999999999999e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.55 
 
 		 1021 aa  286  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.68 
 
 		 967 aa  285  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  30.33 
 
 		 1027 aa  280  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  32.27 
 
 		 971 aa  280  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 1034 aa  279  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  31.15 
 
 		 907 aa  277  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  30.78 
 
 		 970 aa  273  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  33.9 
 
 		 775 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  34.23 
 
 		 910 aa  268  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  39.73 
 
 		 1001 aa  267  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.81 
 
 		 965 aa  265  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  34.37 
 
 		 1346 aa  264  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  31.63 
 
 		 908 aa  264  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  35.84 
 
 		 937 aa  263  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  33.5 
 
 		 995 aa  263  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.2 
 
 		 981 aa  263  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.9 
 
 		 983 aa  261  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  33.26 
 
 		 978 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  32.91 
 
 		 993 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  31.21 
 
 		 928 aa  255  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  32.19 
 
 		 965 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  34.29 
 
 		 1030 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.79 
 
 		 622 aa  244  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  36.14 
 
 		 1033 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.6 
 
 		 632 aa  240  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  30.55 
 
 		 1011 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  30.85 
 
 		 1003 aa  234  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.68 
 
 		 496 aa  233  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  33.81 
 
 		 1024 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 		 850 aa  227  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  32.5 
 
 		 792 aa  224  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  38.23 
 
 		 453 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  31.81 
 
 		 989 aa  218  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  36.46 
 
 		 582 aa  217  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  30.92 
 
 		 1054 aa  216  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.57 
 
 		 631 aa  216  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  37.32 
 
 		 790 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  37.68 
 
 		 994 aa  213  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  33.88 
 
 		 612 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  33.55 
 
 		 810 aa  213  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  33.11 
 
 		 775 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  31.16 
 
 		 806 aa  209  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  33.13 
 
 		 915 aa  207  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  31.23 
 
 		 797 aa  204  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  36.2 
 
 		 838 aa  204  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  29.89 
 
 		 1033 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  31.7 
 
 		 788 aa  197  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  30.92 
 
 		 666 aa  196  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 		 1004 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  30.38 
 
 		 783 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 621 aa  187  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>