More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7082 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 990 aa  1930    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  43.66 
 
 		 1003 aa  601  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  41.42 
 
 		 963 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  35.68 
 
 		 1022 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  38.13 
 
 		 1138 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  35.84 
 
 		 981 aa  432  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.23 
 
 		 996 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  34.88 
 
 		 992 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  35.71 
 
 		 1021 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  39.35 
 
 		 934 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36.44 
 
 		 931 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  44.66 
 
 		 1025 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  40.66 
 
 		 1024 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 1088 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 		 950 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  32.79 
 
 		 992 aa  372  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 654 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  34.56 
 
 		 1022 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.3 
 
 		 965 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  33.92 
 
 		 940 aa  364  4e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 1071 aa  361  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  32.74 
 
 		 941 aa  361  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  33.63 
 
 		 971 aa  357  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  40.88 
 
 		 1010 aa  352  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  37.8 
 
 		 621 aa  349  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 1319 aa  347  5e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.37 
 
 		 1020 aa  347  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  36.85 
 
 		 1108 aa  347  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  40.83 
 
 		 775 aa  347  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.42 
 
 		 1025 aa  347  8e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.44 
 
 		 964 aa  347  8.999999999999999e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  39.97 
 
 		 990 aa  346  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  35.2 
 
 		 1013 aa  345  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  34.01 
 
 		 962 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  30.97 
 
 		 1027 aa  337  5e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  41.04 
 
 		 1030 aa  337  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  40.38 
 
 		 1008 aa  330  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  36.13 
 
 		 1017 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  33.62 
 
 		 993 aa  329  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  39.09 
 
 		 995 aa  329  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  38.99 
 
 		 1014 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.59 
 
 		 907 aa  327  6e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  40.89 
 
 		 935 aa  325  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  32.35 
 
 		 1034 aa  324  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 1346 aa  324  6e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  33.22 
 
 		 1003 aa  323  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  40.42 
 
 		 954 aa  322  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  32.54 
 
 		 965 aa  321  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  41 
 
 		 632 aa  320  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.25 
 
 		 930 aa  319  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  39.97 
 
 		 919 aa  318  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 1033 aa  316  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  39.01 
 
 		 956 aa  315  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.25 
 
 		 921 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.48 
 
 		 921 aa  311  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  31.83 
 
 		 1011 aa  310  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  30.81 
 
 		 946 aa  308  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  33.29 
 
 		 928 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  41.61 
 
 		 926 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  36.18 
 
 		 910 aa  303  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 1048 aa  300  8e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  34.8 
 
 		 1001 aa  296  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  36.23 
 
 		 612 aa  294  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  32.81 
 
 		 970 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  32.67 
 
 		 913 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  36.47 
 
 		 983 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  36 
 
 		 981 aa  287  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  32.63 
 
 		 908 aa  287  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  33.81 
 
 		 910 aa  287  8e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  35.01 
 
 		 1030 aa  286  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  33.26 
 
 		 928 aa  286  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  39.29 
 
 		 915 aa  285  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  30.2 
 
 		 967 aa  285  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  40 
 
 		 496 aa  282  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  36.93 
 
 		 1054 aa  281  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  34.73 
 
 		 788 aa  278  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  38.26 
 
 		 989 aa  275  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  35.38 
 
 		 666 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  34.37 
 
 		 1003 aa  275  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 622 aa  271  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  29.63 
 
 		 1033 aa  270  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  37.29 
 
 		 937 aa  270  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  38.86 
 
 		 582 aa  266  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  38.3 
 
 		 994 aa  254  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.65 
 
 		 631 aa  253  8.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 621 aa  252  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  40.14 
 
 		 453 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  33.81 
 
 		 993 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 982 aa  247  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  36.12 
 
 		 978 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 850 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  32.48 
 
 		 792 aa  234  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  32.14 
 
 		 783 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  43.92 
 
 		 790 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  44.98 
 
 		 761 aa  224  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  42.77 
 
 		 806 aa  222  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  31.26 
 
 		 797 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  31.71 
 
 		 715 aa  219  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  32.14 
 
 		 1004 aa  211  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  29.1 
 
 		 1060 aa  210  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>