More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4597 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 582 aa  1121    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  42.86 
 
 		 1030 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  37.71 
 
 		 1022 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  46.28 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  41.25 
 
 		 940 aa  303  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  41.56 
 
 		 931 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  38.63 
 
 		 1010 aa  293  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  39.78 
 
 		 1014 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 654 aa  287  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  38.86 
 
 		 990 aa  286  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  37.59 
 
 		 990 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  37.18 
 
 		 996 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  38.91 
 
 		 1003 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.84 
 
 		 921 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  39.01 
 
 		 992 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  40 
 
 		 1088 aa  271  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  33.85 
 
 		 1108 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  39.21 
 
 		 950 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  35.52 
 
 		 995 aa  260  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  33.44 
 
 		 1027 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  38.15 
 
 		 954 aa  257  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  36.87 
 
 		 1025 aa  256  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  34.81 
 
 		 907 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  35.11 
 
 		 934 aa  253  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 1022 aa  253  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  36.35 
 
 		 1003 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  33.84 
 
 		 621 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  35.29 
 
 		 992 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  35.92 
 
 		 930 aa  251  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  35.65 
 
 		 981 aa  249  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  36.89 
 
 		 666 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  35.03 
 
 		 981 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  36.22 
 
 		 1025 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  37.08 
 
 		 1021 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  37.48 
 
 		 1020 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 1071 aa  240  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  35.78 
 
 		 921 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  35.41 
 
 		 946 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  35.96 
 
 		 970 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  35.71 
 
 		 919 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  36.75 
 
 		 941 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  36.68 
 
 		 971 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  39.35 
 
 		 965 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  37.3 
 
 		 908 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.62 
 
 		 1013 aa  234  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  37.8 
 
 		 1033 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  36.53 
 
 		 1054 aa  227  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  34.75 
 
 		 1008 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  36.07 
 
 		 956 aa  223  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  36.22 
 
 		 935 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 1048 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  35.03 
 
 		 1003 aa  221  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.26 
 
 		 967 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  36.28 
 
 		 1138 aa  220  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  33.06 
 
 		 1017 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  37.65 
 
 		 928 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.61 
 
 		 631 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  35.42 
 
 		 775 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.63 
 
 		 964 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.83 
 
 		 983 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  33.84 
 
 		 928 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  36.75 
 
 		 1001 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  36.46 
 
 		 963 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  35.99 
 
 		 965 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  32.05 
 
 		 982 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 937 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  35.03 
 
 		 1030 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 622 aa  203  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.73 
 
 		 989 aa  203  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  32.98 
 
 		 913 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  38.31 
 
 		 994 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  36.83 
 
 		 1024 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 1319 aa  193  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  32.64 
 
 		 993 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  41.16 
 
 		 993 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  34.24 
 
 		 612 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  33.62 
 
 		 632 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  32.96 
 
 		 1034 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  39.53 
 
 		 788 aa  183  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  38.3 
 
 		 806 aa  183  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  40.94 
 
 		 797 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  33.05 
 
 		 962 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  39.65 
 
 		 790 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  42.81 
 
 		 1004 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  32.92 
 
 		 978 aa  174  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  40.92 
 
 		 915 aa  173  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  38.58 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  35.02 
 
 		 926 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 1346 aa  164  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 621 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  45.34 
 
 		 1011 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  35.22 
 
 		 910 aa  160  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  38.35 
 
 		 757 aa  160  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.7 
 
 		 1017 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  38.12 
 
 		 715 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 957 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  34.03 
 
 		 910 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 814 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 755 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>