More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0836 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  52.33 
 
 		 1102 aa  860    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  55.42 
 
 		 1125 aa  967    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  53.96 
 
 		 1055 aa  874    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  50.51 
 
 		 1092 aa  828    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  53.14 
 
 		 1103 aa  869    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  100 
 
 		 1017 aa  1967    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  52.87 
 
 		 1158 aa  541  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  47.1 
 
 		 1227 aa  486  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  37.72 
 
 		 1050 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  40.39 
 
 		 1058 aa  456  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.98 
 
 		 1110 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  37.35 
 
 		 1056 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  39.41 
 
 		 1042 aa  449  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  37.64 
 
 		 1087 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.64 
 
 		 1036 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.69 
 
 		 1097 aa  416  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 1100 aa  416  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.95 
 
 		 960 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 1058 aa  399  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  42.07 
 
 		 957 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  39.65 
 
 		 1072 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  38.51 
 
 		 1093 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  41.32 
 
 		 1043 aa  393  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  35.41 
 
 		 1049 aa  382  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  40.22 
 
 		 969 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  36.11 
 
 		 1048 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  36.03 
 
 		 1018 aa  362  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 1094 aa  340  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  35.1 
 
 		 1060 aa  337  9e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 952 aa  334  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  39.43 
 
 		 792 aa  332  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.13 
 
 		 999 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  40.55 
 
 		 1005 aa  323  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  37.42 
 
 		 922 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 1082 aa  318  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  37.25 
 
 		 824 aa  307  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  38.63 
 
 		 1085 aa  298  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 781 aa  298  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 886 aa  293  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 943 aa  293  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  37.7 
 
 		 1119 aa  286  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  43.06 
 
 		 1005 aa  286  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  37.73 
 
 		 1064 aa  283  9e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 1137 aa  282  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  37.81 
 
 		 963 aa  281  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 818 aa  280  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 980 aa  278  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 775 aa  277  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.06 
 
 		 816 aa  274  6e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 882 aa  273  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  41.11 
 
 		 701 aa  270  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 941 aa  270  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 814 aa  266  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  37.75 
 
 		 765 aa  266  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  35.63 
 
 		 799 aa  261  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 1186 aa  260  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  43.12 
 
 		 840 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  40.47 
 
 		 916 aa  252  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 1085 aa  249  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 1049 aa  248  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  43.23 
 
 		 877 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  42.14 
 
 		 887 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  40.22 
 
 		 776 aa  245  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  34.76 
 
 		 943 aa  245  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  43.16 
 
 		 755 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  43 
 
 		 972 aa  244  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  39.7 
 
 		 966 aa  243  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  39.53 
 
 		 921 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 1100 aa  243  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 601 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  44.94 
 
 		 658 aa  240  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  35.7 
 
 		 1131 aa  240  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 901 aa  239  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 591 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  39.05 
 
 		 760 aa  238  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  43.17 
 
 		 591 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  41.4 
 
 		 1010 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  36.08 
 
 		 950 aa  237  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 601 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 601 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  33.38 
 
 		 827 aa  232  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  39.37 
 
 		 678 aa  231  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  39.61 
 
 		 780 aa  229  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 630 aa  229  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  43 
 
 		 1001 aa  228  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 1034 aa  226  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  38.5 
 
 		 928 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  40.8 
 
 		 973 aa  221  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.28 
 
 		 973 aa  217  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 393 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 1027 aa  217  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  40.33 
 
 		 948 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  35.76 
 
 		 1079 aa  214  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 736 aa  214  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 768 aa  213  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  32.85 
 
 		 1076 aa  211  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 948 aa  210  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  38.92 
 
 		 1014 aa  210  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 931 aa  208  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 799 aa  208  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>