More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3101 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 910 aa  1714    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  48.54 
 
 		 926 aa  627  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  46.7 
 
 		 910 aa  615  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  47.1 
 
 		 915 aa  536  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  35.27 
 
 		 934 aa  348  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.04 
 
 		 1022 aa  335  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  35.99 
 
 		 1025 aa  297  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.59 
 
 		 981 aa  296  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  38.28 
 
 		 990 aa  290  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  39.74 
 
 		 992 aa  290  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 		 1013 aa  273  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 1071 aa  271  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  41.01 
 
 		 950 aa  268  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  37.64 
 
 		 990 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 654 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  35.58 
 
 		 1088 aa  265  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  33.94 
 
 		 935 aa  265  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  38.4 
 
 		 1030 aa  265  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.58 
 
 		 921 aa  263  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  38.93 
 
 		 1003 aa  261  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.75 
 
 		 996 aa  261  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  35.44 
 
 		 1024 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  35.09 
 
 		 1108 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  37.97 
 
 		 954 aa  257  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  35.74 
 
 		 995 aa  255  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  37.2 
 
 		 931 aa  255  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  33.61 
 
 		 1003 aa  252  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  35.81 
 
 		 1014 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  32.61 
 
 		 1022 aa  252  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.52 
 
 		 919 aa  251  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  38.03 
 
 		 1010 aa  251  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  36.44 
 
 		 983 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.28 
 
 		 965 aa  247  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  37.43 
 
 		 963 aa  243  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  29.75 
 
 		 1017 aa  238  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34.31 
 
 		 621 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  34.87 
 
 		 930 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  38.09 
 
 		 775 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  40.56 
 
 		 971 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  35.08 
 
 		 913 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  39 
 
 		 1346 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 962 aa  227  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  35.35 
 
 		 992 aa  226  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  35.1 
 
 		 921 aa  225  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  33.56 
 
 		 940 aa  225  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  39.08 
 
 		 1138 aa  223  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  33.02 
 
 		 1027 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  33.04 
 
 		 981 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.99 
 
 		 1033 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.02 
 
 		 1021 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  29.78 
 
 		 907 aa  221  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  30.99 
 
 		 1003 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 1319 aa  219  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  30.89 
 
 		 993 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34.54 
 
 		 941 aa  218  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 		 612 aa  217  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  33.78 
 
 		 982 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 		 989 aa  214  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  36.04 
 
 		 1025 aa  213  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  35.52 
 
 		 1020 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  36.55 
 
 		 928 aa  213  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 622 aa  212  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 1048 aa  207  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  34.29 
 
 		 1030 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  31.48 
 
 		 970 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 993 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  32.25 
 
 		 946 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  35.28 
 
 		 908 aa  201  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 621 aa  201  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  33.22 
 
 		 1001 aa  200  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  35.5 
 
 		 632 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  32.36 
 
 		 956 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  31.18 
 
 		 964 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  33.57 
 
 		 978 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  32.52 
 
 		 1011 aa  197  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  33.71 
 
 		 1034 aa  194  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.45 
 
 		 496 aa  192  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  39.53 
 
 		 453 aa  191  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  31.29 
 
 		 1008 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.01 
 
 		 967 aa  188  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  32.47 
 
 		 666 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  33.73 
 
 		 788 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  37.85 
 
 		 994 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.96 
 
 		 631 aa  185  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.31 
 
 		 915 aa  185  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  42.46 
 
 		 1092 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  30.98 
 
 		 928 aa  174  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  34.43 
 
 		 1004 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  36.82 
 
 		 806 aa  165  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  29.81 
 
 		 965 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  34.24 
 
 		 715 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  33.62 
 
 		 937 aa  161  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  39.35 
 
 		 978 aa  161  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  42.6 
 
 		 1125 aa  158  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  30.88 
 
 		 1054 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  36.41 
 
 		 761 aa  154  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  35.73 
 
 		 790 aa  153  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  38.14 
 
 		 960 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.45 
 
 		 1093 aa  150  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 850 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>