More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8120 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  100 
 
 		 978 aa  1920    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.96 
 
 		 1022 aa  266  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  36.83 
 
 		 1108 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  32.89 
 
 		 1025 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.3 
 
 		 996 aa  205  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 1024 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  30.59 
 
 		 971 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6871  hypothetical protein  28.31 
 
 		 854 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  35.88 
 
 		 954 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  30.07 
 
 		 992 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.05 
 
 		 981 aa  194  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  33.62 
 
 		 1008 aa  188  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.36 
 
 		 1017 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  31.99 
 
 		 930 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  40.35 
 
 		 990 aa  186  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  29.76 
 
 		 1088 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  31.78 
 
 		 1021 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 1071 aa  180  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  33.84 
 
 		 775 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.37 
 
 		 934 aa  180  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  29.86 
 
 		 915 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  32.52 
 
 		 788 aa  178  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  31.69 
 
 		 950 aa  177  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  32.68 
 
 		 1013 aa  175  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  28.39 
 
 		 941 aa  173  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 1346 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  31.63 
 
 		 919 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  28.52 
 
 		 1025 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 1319 aa  169  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  31.26 
 
 		 921 aa  168  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  30.22 
 
 		 964 aa  167  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  37.47 
 
 		 632 aa  167  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  30.44 
 
 		 965 aa  167  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  30.99 
 
 		 940 aa  165  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  37.11 
 
 		 1138 aa  164  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  31.24 
 
 		 931 aa  163  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  36.76 
 
 		 908 aa  163  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  27.83 
 
 		 913 aa  163  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 654 aa  162  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  39.35 
 
 		 910 aa  161  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.09 
 
 		 1020 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  29.67 
 
 		 992 aa  158  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  29.34 
 
 		 797 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  39.15 
 
 		 910 aa  156  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  38.15 
 
 		 926 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.43 
 
 		 962 aa  156  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  29.01 
 
 		 993 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  29.32 
 
 		 790 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  32.51 
 
 		 761 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  34.11 
 
 		 806 aa  155  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  29.29 
 
 		 970 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  30.08 
 
 		 770 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 		 792 aa  151  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  36.13 
 
 		 1014 aa  151  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 850 aa  151  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  29.69 
 
 		 1011 aa  150  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  30.48 
 
 		 946 aa  148  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.3 
 
 		 921 aa  148  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  28.66 
 
 		 792 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 755 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  27.62 
 
 		 715 aa  146  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  36.89 
 
 		 612 aa  146  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  37.98 
 
 		 621 aa  145  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 741 aa  144  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  35.5 
 
 		 1022 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  29.75 
 
 		 928 aa  143  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 1048 aa  142  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  27.1 
 
 		 941 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  32.34 
 
 		 896 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  27.53 
 
 		 1027 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  36.9 
 
 		 1001 aa  138  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.23 
 
 		 1034 aa  138  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  37.13 
 
 		 838 aa  138  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  34.99 
 
 		 1003 aa  137  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  30.67 
 
 		 956 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  31.22 
 
 		 775 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  32.75 
 
 		 995 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  34.73 
 
 		 990 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  35.09 
 
 		 1010 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  37.58 
 
 		 989 aa  133  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  28.47 
 
 		 1004 aa  134  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  30.84 
 
 		 963 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  35.85 
 
 		 715 aa  133  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  27.69 
 
 		 827 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  29.39 
 
 		 907 aa  132  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  36.49 
 
 		 1033 aa  132  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.79 
 
 		 983 aa  131  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  38.36 
 
 		 915 aa  130  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  34.55 
 
 		 981 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  28.13 
 
 		 967 aa  130  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  35.33 
 
 		 814 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  34.17 
 
 		 935 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  33.06 
 
 		 1003 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  34.64 
 
 		 810 aa  129  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  31.01 
 
 		 690 aa  127  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  28.99 
 
 		 783 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 		 782 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  28.87 
 
 		 928 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  30.38 
 
 		 680 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  30.04 
 
 		 937 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>