More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3989 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  43.51 
 
 		 1014 aa  736    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1003 aa  2003    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  38.01 
 
 		 1027 aa  617  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  41.4 
 
 		 1033 aa  608  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  39.92 
 
 		 1010 aa  605  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  39.86 
 
 		 990 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  38.43 
 
 		 995 aa  581  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  39.82 
 
 		 1001 aa  539  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  38.26 
 
 		 1003 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.92 
 
 		 983 aa  524  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  43.95 
 
 		 1030 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.8 
 
 		 1025 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 1071 aa  365  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.67 
 
 		 1020 aa  363  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.02 
 
 		 1088 aa  360  8e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  39.9 
 
 		 940 aa  350  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  38.45 
 
 		 1022 aa  347  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  40.27 
 
 		 934 aa  337  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.09 
 
 		 981 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.5 
 
 		 921 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  29.79 
 
 		 1017 aa  328  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  32.02 
 
 		 931 aa  326  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  39.31 
 
 		 990 aa  322  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  35.69 
 
 		 1108 aa  320  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  39.49 
 
 		 921 aa  320  7e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  36.69 
 
 		 621 aa  318  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  37.21 
 
 		 946 aa  315  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  40.43 
 
 		 930 aa  313  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 654 aa  312  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  30.41 
 
 		 1022 aa  308  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  39.06 
 
 		 992 aa  307  7e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  37.86 
 
 		 956 aa  307  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  35 
 
 		 965 aa  305  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  37.97 
 
 		 919 aa  305  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  30.5 
 
 		 1011 aa  297  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  41.12 
 
 		 496 aa  295  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 		 996 aa  288  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  35.81 
 
 		 992 aa  288  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  31.36 
 
 		 964 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  38.32 
 
 		 941 aa  285  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 1048 aa  284  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  37.82 
 
 		 950 aa  284  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  38 
 
 		 963 aa  283  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  36.32 
 
 		 928 aa  282  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  37.44 
 
 		 1003 aa  280  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  36.22 
 
 		 907 aa  280  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  32.48 
 
 		 954 aa  280  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  36.51 
 
 		 928 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  36.08 
 
 		 1054 aa  276  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  32.48 
 
 		 935 aa  274  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 913 aa  274  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.65 
 
 		 1034 aa  270  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  35.93 
 
 		 1025 aa  266  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  34.63 
 
 		 908 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  38.73 
 
 		 1013 aa  266  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  35.64 
 
 		 612 aa  266  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  35.89 
 
 		 981 aa  265  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  32.62 
 
 		 1008 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  33.16 
 
 		 982 aa  260  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  39.85 
 
 		 1021 aa  257  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  30.94 
 
 		 915 aa  255  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.28 
 
 		 989 aa  254  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  34.71 
 
 		 993 aa  254  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  34.55 
 
 		 970 aa  251  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  38.57 
 
 		 582 aa  251  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 621 aa  250  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  38.93 
 
 		 910 aa  249  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  36.15 
 
 		 965 aa  249  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  36.58 
 
 		 971 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  36.53 
 
 		 775 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  39.86 
 
 		 453 aa  244  9e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  35.26 
 
 		 962 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 1319 aa  238  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  39.9 
 
 		 915 aa  238  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  41.55 
 
 		 788 aa  237  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  32.34 
 
 		 926 aa  236  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  36.89 
 
 		 910 aa  234  8.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 1346 aa  233  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.95 
 
 		 967 aa  231  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.9 
 
 		 1030 aa  230  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  32.79 
 
 		 937 aa  228  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  36.75 
 
 		 1024 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 1138 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  41.32 
 
 		 993 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  38.91 
 
 		 994 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 850 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 		 632 aa  218  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 622 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  40.9 
 
 		 790 aa  212  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  41.53 
 
 		 806 aa  211  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  33.98 
 
 		 666 aa  211  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  30.59 
 
 		 978 aa  208  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.02 
 
 		 631 aa  203  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  42.09 
 
 		 814 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  30.51 
 
 		 797 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  41.03 
 
 		 370 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  32.75 
 
 		 1058 aa  199  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  40.06 
 
 		 757 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  30.93 
 
 		 1004 aa  194  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  40.06 
 
 		 715 aa  193  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>