More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2066 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  65.97 
 
 		 1042 aa  1271    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 1058 aa  2049    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  58.26 
 
 		 1050 aa  1120    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  43.4 
 
 		 1087 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  43.04 
 
 		 1056 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40.13 
 
 		 1100 aa  565  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  43.02 
 
 		 1036 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  42.75 
 
 		 1072 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 1066 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  41.72 
 
 		 1110 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  39.68 
 
 		 1097 aa  532  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 1058 aa  509  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  38.74 
 
 		 1043 aa  500  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.71 
 
 		 1125 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  37.21 
 
 		 1049 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  38 
 
 		 1093 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  39.07 
 
 		 1092 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.7 
 
 		 1017 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.45 
 
 		 1094 aa  452  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.17 
 
 		 1055 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 1082 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.63 
 
 		 1103 aa  436  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  42.54 
 
 		 1102 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  40 
 
 		 1060 aa  422  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  36.03 
 
 		 1048 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.92 
 
 		 960 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  38.04 
 
 		 1028 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 957 aa  380  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 952 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 922 aa  373  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 1005 aa  349  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  39.41 
 
 		 1158 aa  344  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  38.63 
 
 		 1018 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  38.69 
 
 		 824 aa  328  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.19 
 
 		 943 aa  318  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 1186 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 969 aa  314  6.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  36.53 
 
 		 1005 aa  301  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 781 aa  301  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  35.66 
 
 		 1131 aa  296  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.25 
 
 		 999 aa  295  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  40.48 
 
 		 792 aa  290  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  31.6 
 
 		 1064 aa  289  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.36 
 
 		 1227 aa  289  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 886 aa  287  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  37.63 
 
 		 701 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  43.82 
 
 		 1085 aa  275  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 963 aa  273  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  35.27 
 
 		 941 aa  272  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 775 aa  267  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  38.7 
 
 		 818 aa  261  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  33.92 
 
 		 1076 aa  260  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  37.47 
 
 		 765 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.65 
 
 		 840 aa  254  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 980 aa  253  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  36.44 
 
 		 1027 aa  253  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 1137 aa  253  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  41.43 
 
 		 1119 aa  251  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 1049 aa  251  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 1161 aa  248  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 943 aa  245  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.33 
 
 		 816 aa  245  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  34.02 
 
 		 799 aa  244  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  34 
 
 		 1079 aa  244  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  40.9 
 
 		 760 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  35.74 
 
 		 1100 aa  243  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 882 aa  240  8e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 972 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  36.81 
 
 		 950 aa  237  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  42 
 
 		 887 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 779 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.46 
 
 		 916 aa  235  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  40 
 
 		 678 aa  235  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 814 aa  234  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 1064 aa  234  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 1085 aa  233  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  38.44 
 
 		 921 aa  233  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  40.16 
 
 		 877 aa  233  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  34.11 
 
 		 1044 aa  226  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 831 aa  226  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  34.6 
 
 		 966 aa  226  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 1034 aa  224  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  37.78 
 
 		 755 aa  223  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 961 aa  223  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  34.6 
 
 		 1060 aa  223  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  40.16 
 
 		 1001 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  37.81 
 
 		 780 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 658 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 1010 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  36.05 
 
 		 776 aa  213  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  40.09 
 
 		 907 aa  212  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  41.26 
 
 		 601 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 591 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 878 aa  211  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 393 aa  211  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  37.37 
 
 		 827 aa  209  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  38.48 
 
 		 931 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 948 aa  209  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  41.83 
 
 		 591 aa  207  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 973 aa  207  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>