More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1468 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 969 aa  1845    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.86 
 
 		 1092 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 1100 aa  396  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.96 
 
 		 1125 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.35 
 
 		 957 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  40.65 
 
 		 1102 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  40.48 
 
 		 1017 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.81 
 
 		 1055 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.86 
 
 		 1103 aa  360  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  36.79 
 
 		 960 aa  360  9e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  37.84 
 
 		 1072 aa  358  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  42.37 
 
 		 1110 aa  353  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  36.4 
 
 		 1087 aa  352  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  35.75 
 
 		 1097 aa  350  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  41 
 
 		 1158 aa  347  6e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 1058 aa  342  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 1043 aa  343  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  38.38 
 
 		 1093 aa  340  9e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  37.92 
 
 		 1050 aa  337  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  35.43 
 
 		 1018 aa  336  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  36.83 
 
 		 1056 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  36.92 
 
 		 943 aa  332  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 1066 aa  330  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  37.64 
 
 		 1042 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  33.37 
 
 		 952 aa  323  9.000000000000001e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.87 
 
 		 1058 aa  323  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  32.29 
 
 		 943 aa  317  6e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 		 1049 aa  310  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  38.62 
 
 		 1036 aa  308  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 1082 aa  308  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  40.19 
 
 		 1005 aa  303  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  40.07 
 
 		 1085 aa  302  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  38.76 
 
 		 980 aa  290  8e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 1137 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  35.61 
 
 		 1048 aa  281  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  38.12 
 
 		 1060 aa  280  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.63 
 
 		 999 aa  279  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  35.99 
 
 		 963 aa  277  8e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 882 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  38.32 
 
 		 1028 aa  276  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 1085 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  32.28 
 
 		 701 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 941 aa  261  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  44.08 
 
 		 1119 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  33.29 
 
 		 1064 aa  259  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 887 aa  257  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  39.31 
 
 		 1005 aa  254  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  38.47 
 
 		 781 aa  252  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  37.21 
 
 		 824 aa  250  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  35.03 
 
 		 792 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  34.7 
 
 		 1131 aa  246  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 814 aa  242  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  45.53 
 
 		 1123 aa  240  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  35.73 
 
 		 840 aa  237  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 775 aa  237  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  34.76 
 
 		 630 aa  233  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  35.69 
 
 		 630 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  44.32 
 
 		 765 aa  230  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 1186 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  41.76 
 
 		 678 aa  228  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  52.43 
 
 		 1118 aa  228  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 922 aa  226  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  36.14 
 
 		 1227 aa  226  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.58 
 
 		 816 aa  225  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  36.35 
 
 		 799 aa  224  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 755 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  33.56 
 
 		 1049 aa  221  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  39.22 
 
 		 1000 aa  220  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.96 
 
 		 916 aa  220  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  40.57 
 
 		 760 aa  219  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 886 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 393 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  39.55 
 
 		 907 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  33.19 
 
 		 777 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  43.07 
 
 		 921 aa  213  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  39.95 
 
 		 982 aa  212  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  34.43 
 
 		 1100 aa  211  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  47.38 
 
 		 1123 aa  211  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  39.96 
 
 		 965 aa  211  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  38.49 
 
 		 658 aa  210  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  42.12 
 
 		 973 aa  208  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  41.44 
 
 		 780 aa  207  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  39.15 
 
 		 972 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  44.41 
 
 		 878 aa  206  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  50.8 
 
 		 1121 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  41.37 
 
 		 1141 aa  206  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  31.26 
 
 		 831 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 922 aa  205  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  44.26 
 
 		 951 aa  203  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  32.76 
 
 		 1076 aa  203  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  31.86 
 
 		 776 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  32.6 
 
 		 981 aa  202  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  34.73 
 
 		 950 aa  202  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  34.63 
 
 		 818 aa  202  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  36.81 
 
 		 1001 aa  201  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 888 aa  201  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 1010 aa  200  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  35.37 
 
 		 768 aa  199  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  46.7 
 
 		 1161 aa  198  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 966 aa  197  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>