More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5782 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  58.2 
 
 		 1092 aa  1050    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  55.23 
 
 		 1102 aa  981    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  62.97 
 
 		 1125 aa  1236    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  53.71 
 
 		 1055 aa  870    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  100 
 
 		 1103 aa  2136    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  53.23 
 
 		 1017 aa  900    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 1227 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  43.93 
 
 		 1158 aa  556  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  40.93 
 
 		 1056 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  38.58 
 
 		 1087 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.95 
 
 		 1100 aa  469  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 1097 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 1042 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  36.14 
 
 		 1050 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.49 
 
 		 1110 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 1049 aa  446  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  38 
 
 		 1058 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 1058 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  40.36 
 
 		 1072 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.04 
 
 		 1043 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  37.15 
 
 		 1048 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.9 
 
 		 1036 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  41.72 
 
 		 1066 aa  423  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.9 
 
 		 1093 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  37.65 
 
 		 1060 aa  395  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.83 
 
 		 960 aa  396  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.72 
 
 		 957 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 1005 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.86 
 
 		 969 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  37.01 
 
 		 1028 aa  364  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  33.94 
 
 		 1018 aa  361  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.55 
 
 		 999 aa  357  6.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.13 
 
 		 952 aa  339  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  38.07 
 
 		 792 aa  338  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 1082 aa  336  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  37.16 
 
 		 1094 aa  334  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  38.58 
 
 		 922 aa  334  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.08 
 
 		 1085 aa  312  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  36.92 
 
 		 824 aa  310  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 781 aa  304  8.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 775 aa  300  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 1137 aa  291  6e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.45 
 
 		 816 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 818 aa  283  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 943 aa  281  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  35.88 
 
 		 799 aa  279  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 901 aa  274  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  36.63 
 
 		 1005 aa  274  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  36.16 
 
 		 701 aa  272  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  37.02 
 
 		 886 aa  270  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  44.68 
 
 		 840 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  33.01 
 
 		 943 aa  258  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  35.45 
 
 		 1131 aa  258  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 887 aa  255  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 1085 aa  254  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  37 
 
 		 1034 aa  253  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 972 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  32.97 
 
 		 1064 aa  246  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  33.84 
 
 		 827 aa  245  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 963 aa  241  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 1049 aa  241  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  41.42 
 
 		 1186 aa  240  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  38.54 
 
 		 780 aa  237  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 814 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  42.05 
 
 		 916 aa  237  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 765 aa  237  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 755 aa  234  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 928 aa  231  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  34.99 
 
 		 921 aa  231  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  35.79 
 
 		 776 aa  228  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  36.06 
 
 		 980 aa  228  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  39.95 
 
 		 1010 aa  224  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 1161 aa  224  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  37.02 
 
 		 1076 aa  223  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  34.89 
 
 		 1079 aa  224  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 941 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 768 aa  223  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  39.8 
 
 		 1060 aa  223  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 910 aa  221  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 966 aa  221  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 736 aa  221  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  29.67 
 
 		 777 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 1001 aa  218  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 799 aa  216  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  38.11 
 
 		 877 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  34.26 
 
 		 1100 aa  213  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  35.95 
 
 		 950 aa  213  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  32.69 
 
 		 961 aa  213  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 726 aa  213  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  38.48 
 
 		 658 aa  209  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 812 aa  209  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  36.74 
 
 		 779 aa  208  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  32.13 
 
 		 973 aa  208  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  36.62 
 
 		 678 aa  207  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  38.35 
 
 		 948 aa  204  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 922 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  37.64 
 
 		 601 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  40.27 
 
 		 948 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  28.36 
 
 		 981 aa  202  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 973 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>