More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0758 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  100 
 
 
827 aa  1637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  44.28 
 
 
818 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  35.9 
 
 
824 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  36.56 
 
 
799 aa  382  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  36.1 
 
 
886 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 
840 aa  298  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  32.97 
 
 
792 aa  296  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
781 aa  283  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33 
 
 
999 aa  271  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  33.25 
 
 
775 aa  271  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  34.41 
 
 
1125 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  33.78 
 
 
1085 aa  259  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  33.64 
 
 
1056 aa  259  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  34.77 
 
 
1119 aa  259  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  33.91 
 
 
1227 aa  253  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  30.84 
 
 
901 aa  252  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  32.42 
 
 
1092 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  34.3 
 
 
1103 aa  250  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  35.02 
 
 
1055 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
814 aa  248  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  36.5 
 
 
1050 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  28.51 
 
 
816 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  34.66 
 
 
840 aa  244  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  33.38 
 
 
1017 aa  243  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  30.14 
 
 
776 aa  243  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.41 
 
 
1102 aa  242  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
1137 aa  238  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  38.88 
 
 
1049 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  35.6 
 
 
960 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.61 
 
 
916 aa  234  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  35.31 
 
 
701 aa  230  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.44 
 
 
760 aa  230  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  36.99 
 
 
1066 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 
1042 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 
1093 aa  225  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
882 aa  225  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  37.44 
 
 
887 aa  224  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  32.6 
 
 
780 aa  224  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 
768 aa  223  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 
1058 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
393 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
1085 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  32.21 
 
 
921 aa  217  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  32.87 
 
 
1087 aa  216  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  32.01 
 
 
950 aa  213  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  27.18 
 
 
975 aa  211  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  38.44 
 
 
1058 aa  211  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  36.44 
 
 
755 aa  210  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  40.98 
 
 
1060 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  37.83 
 
 
765 aa  209  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  38.24 
 
 
1036 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  33.89 
 
 
1064 aa  207  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.41 
 
 
1110 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  38.27 
 
 
973 aa  207  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  38.3 
 
 
1097 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 
1010 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  37.99 
 
 
973 aa  204  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  32.96 
 
 
1072 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  39.94 
 
 
601 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  39.04 
 
 
948 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  32.12 
 
 
972 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  39 
 
 
948 aa  198  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  31.3 
 
 
1100 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  29.43 
 
 
777 aa  197  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  31.39 
 
 
1043 aa  197  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
798 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 
906 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
1082 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  37.4 
 
 
1001 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
799 aa  195  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  39.67 
 
 
601 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  39.67 
 
 
601 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  29.02 
 
 
910 aa  194  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  36.43 
 
 
973 aa  193  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  33.12 
 
 
969 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  37.22 
 
 
928 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  36.8 
 
 
1048 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  29.63 
 
 
1018 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 
957 aa  192  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  36.61 
 
 
618 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  36.6 
 
 
658 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 
831 aa  190  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  38.76 
 
 
591 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 
1014 aa  188  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  39.68 
 
 
1094 aa  188  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  34.58 
 
 
966 aa  187  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  39.44 
 
 
1158 aa  187  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  36.26 
 
 
591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  34.26 
 
 
877 aa  185  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  33.57 
 
 
952 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  36.94 
 
 
954 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  38.06 
 
 
951 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  33.66 
 
 
1131 aa  181  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  36.98 
 
 
919 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  32.22 
 
 
678 aa  180  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  37.64 
 
 
1100 aa  179  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  34.16 
 
 
907 aa  179  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  36.59 
 
 
953 aa  178  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  36.48 
 
 
931 aa  177  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  33.26 
 
 
982 aa  177  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>