More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0492 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  100 
 
 
963 aa  1887    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  54.3 
 
 
980 aa  807    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  50.26 
 
 
943 aa  779    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  90.18 
 
 
941 aa  1515    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 
1141 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.62 
 
 
957 aa  345  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  36.91 
 
 
1042 aa  308  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  51.32 
 
 
878 aa  301  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  36.6 
 
 
1066 aa  299  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  36.12 
 
 
1058 aa  297  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.81 
 
 
952 aa  296  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.72 
 
 
1017 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  35.36 
 
 
1050 aa  293  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  37.87 
 
 
1058 aa  281  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.25 
 
 
1125 aa  280  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  38.69 
 
 
1018 aa  278  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  36.51 
 
 
960 aa  277  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 
969 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  34.46 
 
 
1056 aa  276  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.99 
 
 
1092 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 
1100 aa  274  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.04 
 
 
1043 aa  272  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  36.17 
 
 
1110 aa  272  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.6 
 
 
1097 aa  271  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  36.26 
 
 
1087 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.44 
 
 
943 aa  265  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.42 
 
 
1102 aa  259  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  38.08 
 
 
1036 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.93 
 
 
1093 aa  255  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 
1158 aa  253  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 
1049 aa  251  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  37.29 
 
 
1072 aa  251  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  34.65 
 
 
1103 aa  247  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 
922 aa  239  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  35.9 
 
 
1055 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
1082 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 
1094 aa  229  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  33.19 
 
 
1131 aa  228  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  32.91 
 
 
1064 aa  224  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 
1028 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  34.1 
 
 
1005 aa  215  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  33.63 
 
 
1048 aa  214  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  35.23 
 
 
1060 aa  211  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
882 aa  207  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 
1049 aa  202  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  37.16 
 
 
840 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.38 
 
 
1085 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  30.78 
 
 
999 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  41.5 
 
 
887 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  33.63 
 
 
792 aa  197  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  40.78 
 
 
755 aa  194  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  35.89 
 
 
824 aa  194  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
1085 aa  194  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  41.48 
 
 
919 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.55 
 
 
760 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  37.91 
 
 
1186 aa  192  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  33.96 
 
 
921 aa  191  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
775 aa  190  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  40.63 
 
 
1137 aa  188  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  38.64 
 
 
916 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  31.56 
 
 
1100 aa  187  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  34.3 
 
 
765 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  36.36 
 
 
972 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 
1076 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  39 
 
 
818 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  39.71 
 
 
973 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
781 aa  183  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.43 
 
 
973 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  33.61 
 
 
1161 aa  183  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 
931 aa  183  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  33.5 
 
 
630 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  40.91 
 
 
948 aa  179  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
393 aa  179  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  40.52 
 
 
948 aa  179  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  39.83 
 
 
886 aa  178  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  31.38 
 
 
701 aa  177  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 
1005 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  36.76 
 
 
877 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  31.94 
 
 
630 aa  177  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  37.78 
 
 
973 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  33.17 
 
 
1079 aa  175  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  34.31 
 
 
959 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  37.85 
 
 
1010 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  40.17 
 
 
951 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5104  transcriptional regulator, SARP family  34.05 
 
 
994 aa  174  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  37.17 
 
 
928 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  30.59 
 
 
1064 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  32.05 
 
 
780 aa  172  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  34.6 
 
 
1227 aa  172  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.86 
 
 
966 aa  170  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  35.39 
 
 
827 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  32.93 
 
 
950 aa  167  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  38.18 
 
 
1119 aa  167  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  38.51 
 
 
907 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  35.12 
 
 
1000 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  40.24 
 
 
938 aa  166  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  32.03 
 
 
831 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  33.87 
 
 
490 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  37.26 
 
 
1001 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  35.01 
 
 
768 aa  165  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>