More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5717 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  54.18 
 
 		 973 aa  882    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  100 
 
 		 973 aa  1945    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  53.48 
 
 		 948 aa  858    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  54.24 
 
 		 973 aa  889    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 1014 aa  798    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  53.01 
 
 		 948 aa  856    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  49.29 
 
 		 618 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  39.52 
 
 		 1001 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 966 aa  482  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 877 aa  479  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  36.24 
 
 		 1010 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  64.52 
 
 		 502 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  35.3 
 
 		 972 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  43.46 
 
 		 658 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  43.76 
 
 		 591 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 601 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 591 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  43.12 
 
 		 601 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  43.12 
 
 		 601 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  32.75 
 
 		 950 aa  363  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  30.89 
 
 		 961 aa  361  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 950 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  31.01 
 
 		 921 aa  355  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  44.4 
 
 		 493 aa  350  7e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  44.18 
 
 		 493 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  44.18 
 
 		 493 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1478  tetratricopeptide TPR_4  47.81 
 
 		 472 aa  347  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 959 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  42.89 
 
 		 481 aa  336  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4035  transcriptional regulator, winged helix family  31.83 
 
 		 946 aa  329  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  31.12 
 
 		 956 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 954 aa  320  7.999999999999999e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 928 aa  307  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  42.12 
 
 		 468 aa  307  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  32.19 
 
 		 953 aa  294  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  31.65 
 
 		 906 aa  291  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 490 aa  258  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  35.13 
 
 		 922 aa  254  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  40.57 
 
 		 1066 aa  241  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  39 
 
 		 999 aa  241  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  30.47 
 
 		 901 aa  241  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  38.84 
 
 		 1087 aa  234  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  35.79 
 
 		 1085 aa  228  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 1093 aa  225  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  34.74 
 
 		 701 aa  224  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 1085 aa  218  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 781 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  40.44 
 
 		 1102 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  40.4 
 
 		 1060 aa  214  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 1137 aa  214  9e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  40.38 
 
 		 1092 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  39.39 
 
 		 1050 aa  211  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  35.16 
 
 		 792 aa  210  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 882 aa  209  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 1042 aa  210  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  34.54 
 
 		 1119 aa  207  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  32.57 
 
 		 1097 aa  207  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 886 aa  207  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  40.25 
 
 		 916 aa  207  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 1058 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 887 aa  207  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 816 aa  206  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 952 aa  205  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  38.42 
 
 		 760 aa  204  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  40.48 
 
 		 1058 aa  203  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  40 
 
 		 1056 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  38.3 
 
 		 1227 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.5 
 
 		 1125 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  38.87 
 
 		 840 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  38.82 
 
 		 1141 aa  201  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  41.64 
 
 		 1072 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  42.12 
 
 		 969 aa  201  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  40.34 
 
 		 1055 aa  201  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  31.64 
 
 		 824 aa  201  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  36.61 
 
 		 799 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  35.37 
 
 		 780 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  35.28 
 
 		 818 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 765 aa  198  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 957 aa  198  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  38.64 
 
 		 1103 aa  197  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 775 aa  197  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 1043 aa  194  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.9 
 
 		 1110 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  36.5 
 
 		 827 aa  192  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 1049 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.56 
 
 		 1100 aa  192  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  31.52 
 
 		 504 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.16 
 
 		 960 aa  192  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  33.78 
 
 		 776 aa  191  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  36.77 
 
 		 755 aa  187  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  38.8 
 
 		 943 aa  187  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  39.53 
 
 		 1131 aa  185  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  40.22 
 
 		 878 aa  186  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 901 aa  184  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  28.86 
 
 		 888 aa  184  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 393 aa  182  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 975 aa  182  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.93 
 
 		 1094 aa  178  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  34.04 
 
 		 1018 aa  178  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 736 aa  177  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>