More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2409 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  100 
 
 
1119 aa  2143    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  38.33 
 
 
999 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  52.39 
 
 
781 aa  349  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  45.61 
 
 
1085 aa  349  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  34.49 
 
 
1125 aa  332  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.82 
 
 
816 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  40.07 
 
 
792 aa  320  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  41.43 
 
 
701 aa  317  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
1137 aa  313  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 
1049 aa  313  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  40.11 
 
 
882 aa  312  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  34.36 
 
 
1087 aa  310  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  36.71 
 
 
824 aa  310  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  34.46 
 
 
1103 aa  309  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  35.44 
 
 
1092 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  35.53 
 
 
960 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  35.26 
 
 
1066 aa  305  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  37.85 
 
 
1050 aa  303  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.81 
 
 
1102 aa  301  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  36.88 
 
 
886 aa  301  6e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
1085 aa  300  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  36.85 
 
 
799 aa  298  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  34.7 
 
 
1042 aa  296  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  35.23 
 
 
1017 aa  296  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 
765 aa  295  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 
1100 aa  291  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  47.49 
 
 
887 aa  291  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 
775 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  34.66 
 
 
1058 aa  285  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.1 
 
 
957 aa  283  9e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  35.01 
 
 
952 aa  281  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  45.04 
 
 
755 aa  281  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.16 
 
 
969 aa  280  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.82 
 
 
1110 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  43.1 
 
 
1056 aa  275  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.5 
 
 
1097 aa  273  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 
1058 aa  273  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  43.9 
 
 
1227 aa  270  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  36.98 
 
 
1072 aa  269  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  34.83 
 
 
1093 aa  269  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.1 
 
 
1036 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  39.12 
 
 
760 aa  265  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  42.62 
 
 
916 aa  265  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.98 
 
 
840 aa  264  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  38.81 
 
 
780 aa  264  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
814 aa  263  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  44.99 
 
 
393 aa  261  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  41.83 
 
 
1043 aa  261  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 
768 aa  261  7e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  36.93 
 
 
818 aa  261  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 
901 aa  260  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
1082 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  31.84 
 
 
1056 aa  256  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  40.45 
 
 
776 aa  256  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  36.67 
 
 
1055 aa  252  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  40.62 
 
 
678 aa  252  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.36 
 
 
827 aa  250  9e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  37.98 
 
 
950 aa  250  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  42.44 
 
 
1060 aa  249  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  40.56 
 
 
919 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  39.57 
 
 
966 aa  245  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  34.02 
 
 
831 aa  243  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  38.34 
 
 
1005 aa  238  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  42.94 
 
 
972 aa  234  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  31.18 
 
 
777 aa  234  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  33.59 
 
 
1064 aa  234  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 
921 aa  233  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  35.74 
 
 
1048 aa  232  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  28.79 
 
 
975 aa  231  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  31.44 
 
 
888 aa  231  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  41.47 
 
 
1094 aa  229  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  41.94 
 
 
601 aa  228  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  41.94 
 
 
601 aa  225  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  41.94 
 
 
601 aa  225  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 
1005 aa  224  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  38.48 
 
 
877 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
736 aa  221  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 
1158 aa  220  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  42.39 
 
 
951 aa  219  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  39.56 
 
 
658 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  40.86 
 
 
973 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 
910 aa  217  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  42.71 
 
 
931 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  39.06 
 
 
1001 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  42.34 
 
 
591 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  34.42 
 
 
973 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  40.57 
 
 
973 aa  214  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  32.6 
 
 
1064 aa  214  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  35.31 
 
 
950 aa  214  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  37.5 
 
 
928 aa  213  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  42.97 
 
 
591 aa  214  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  37.41 
 
 
1010 aa  213  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  38.53 
 
 
907 aa  212  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  31.08 
 
 
1018 aa  211  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  40.68 
 
 
618 aa  211  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  41.67 
 
 
948 aa  211  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  38.04 
 
 
779 aa  211  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  37.74 
 
 
953 aa  209  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  35.94 
 
 
1014 aa  209  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  32.25 
 
 
1044 aa  208  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>