230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3482 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  100 
 
 		 777 aa  1567    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  32.67 
 
 		 840 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  32.6 
 
 		 701 aa  296  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  33.07 
 
 		 792 aa  281  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 814 aa  276  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  31.58 
 
 		 780 aa  273  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  32.39 
 
 		 960 aa  250  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 775 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 1058 aa  230  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  32.08 
 
 		 678 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  34.57 
 
 		 1087 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  33.87 
 
 		 1085 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.83 
 
 		 1097 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  33.39 
 
 		 755 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  31.23 
 
 		 1119 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  33.97 
 
 		 1050 aa  220  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  29.68 
 
 		 999 aa  219  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  36.22 
 
 		 1056 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  30.35 
 
 		 776 aa  217  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 1066 aa  216  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  35.01 
 
 		 760 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  24.9 
 
 		 816 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  30.83 
 
 		 916 aa  213  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  29 
 
 		 1092 aa  211  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  36.71 
 
 		 1018 aa  210  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 1042 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  36.32 
 
 		 1060 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 882 aa  209  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 1043 aa  207  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  29.67 
 
 		 1103 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  34.57 
 
 		 969 aa  206  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.2 
 
 		 1100 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 1137 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  33.49 
 
 		 1102 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  35.45 
 
 		 1055 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  36.39 
 
 		 1110 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.03 
 
 		 1036 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  31.57 
 
 		 1125 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 781 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  33.49 
 
 		 957 aa  195  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  32.5 
 
 		 1049 aa  195  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  33.47 
 
 		 1058 aa  192  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  40.66 
 
 		 1048 aa  190  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  33.26 
 
 		 907 aa  190  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  34 
 
 		 952 aa  188  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 765 aa  187  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  34.71 
 
 		 887 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  30.8 
 
 		 824 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  36.02 
 
 		 1072 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  30.83 
 
 		 644 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  34.27 
 
 		 1093 aa  185  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  36.98 
 
 		 418 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  31.12 
 
 		 827 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 931 aa  183  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  29.06 
 
 		 982 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 1085 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  33.56 
 
 		 1227 aa  183  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  29.6 
 
 		 768 aa  182  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 1082 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  37.22 
 
 		 951 aa  181  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 901 aa  180  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 886 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 393 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  32.22 
 
 		 1017 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  31.93 
 
 		 818 aa  174  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  31.71 
 
 		 799 aa  173  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  31.49 
 
 		 921 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 831 aa  172  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  31.61 
 
 		 877 aa  171  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  32.78 
 
 		 1076 aa  170  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 1094 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  31.91 
 
 		 943 aa  168  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 966 aa  168  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 888 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 802 aa  167  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  35.58 
 
 		 922 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 961 aa  166  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  30.02 
 
 		 973 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  29.36 
 
 		 950 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  38.07 
 
 		 1028 aa  165  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  33.6 
 
 		 1010 aa  165  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  28.96 
 
 		 1158 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  33.16 
 
 		 1141 aa  163  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  33.25 
 
 		 658 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 812 aa  161  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 		 919 aa  160  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  34.03 
 
 		 1100 aa  160  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2078  transcriptional regulator, LuxR family  36.81 
 
 		 940 aa  158  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.9735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  35.26 
 
 		 490 aa  158  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 980 aa  158  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 972 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 956 aa  157  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.41 
 
 		 1104 aa  156  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 1161 aa  155  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 726 aa  154  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  30.89 
 
 		 1056 aa  154  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  31.92 
 
 		 973 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  32.03 
 
 		 1064 aa  153  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  31.92 
 
 		 973 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 1049 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>