299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1145 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
736 aa  1494    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
726 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  33.78 
 
 
797 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 
816 aa  290  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  33.06 
 
 
872 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  30.84 
 
 
999 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
729 aa  255  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 
901 aa  246  8e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
799 aa  243  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  30.57 
 
 
975 aa  238  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  30.58 
 
 
910 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  31.65 
 
 
768 aa  230  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
781 aa  224  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
882 aa  221  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  30.24 
 
 
1125 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
798 aa  217  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  31.56 
 
 
1103 aa  217  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  32.45 
 
 
916 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  31.22 
 
 
1092 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  31.52 
 
 
1227 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  28.37 
 
 
812 aa  214  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  31.18 
 
 
792 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  29.9 
 
 
1119 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  29.39 
 
 
1049 aa  208  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  32.37 
 
 
1085 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  29.02 
 
 
701 aa  204  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  27.88 
 
 
888 aa  203  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  34.87 
 
 
1056 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  29.77 
 
 
1102 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  30.72 
 
 
1055 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  31.73 
 
 
886 aa  201  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  33.1 
 
 
1066 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  36.19 
 
 
1005 aa  198  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  30.8 
 
 
831 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  29.49 
 
 
1017 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
1085 aa  192  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 
802 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  29.55 
 
 
824 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 
840 aa  191  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.41 
 
 
1056 aa  190  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  32.53 
 
 
887 aa  190  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  28.85 
 
 
1058 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.73 
 
 
1104 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  33.49 
 
 
1087 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  33.94 
 
 
779 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  31.31 
 
 
1050 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 
957 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  28.14 
 
 
996 aa  183  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  29.15 
 
 
780 aa  183  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  33.77 
 
 
952 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  34.62 
 
 
877 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  32.56 
 
 
840 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  27.25 
 
 
1018 aa  180  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  30.52 
 
 
776 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  31.96 
 
 
1042 aa  178  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  32.88 
 
 
973 aa  177  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  26.95 
 
 
804 aa  177  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  31.94 
 
 
618 aa  177  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  31.16 
 
 
1036 aa  174  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  32.68 
 
 
1110 aa  173  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  32.51 
 
 
601 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  34.34 
 
 
972 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
1137 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  31.53 
 
 
950 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  26.84 
 
 
799 aa  171  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  32.06 
 
 
1100 aa  170  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  29.78 
 
 
1097 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  30.47 
 
 
678 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  29.35 
 
 
960 aa  167  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  31.41 
 
 
1014 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  32.51 
 
 
601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  32.24 
 
 
1072 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  32.51 
 
 
601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  33.41 
 
 
1043 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
775 aa  165  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2158  ATPase-like  25.51 
 
 
856 aa  165  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  30.25 
 
 
966 aa  164  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  31.5 
 
 
906 aa  163  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  31.53 
 
 
1010 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  29.35 
 
 
760 aa  160  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  26.6 
 
 
928 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  30.91 
 
 
1060 aa  159  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  27.33 
 
 
827 aa  158  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  32.51 
 
 
591 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  31.16 
 
 
953 aa  158  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  33.5 
 
 
591 aa  158  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  30.37 
 
 
1001 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  33.24 
 
 
973 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  30.41 
 
 
921 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  26.48 
 
 
818 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  32.96 
 
 
973 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  31.92 
 
 
950 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
814 aa  154  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  33.56 
 
 
1094 aa  152  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  29.7 
 
 
1058 aa  150  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  32.29 
 
 
948 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  27.15 
 
 
992 aa  148  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  30.32 
 
 
493 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  30.32 
 
 
493 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  30.07 
 
 
755 aa  146  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>