More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5187 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
950 aa  1915    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  44.67 
 
 
972 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  58.09 
 
 
921 aa  1045    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  33.09 
 
 
961 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  36.29 
 
 
1001 aa  432  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  35.95 
 
 
1010 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  34.99 
 
 
966 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  33.74 
 
 
1014 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4035  transcriptional regulator, winged helix family  32.95 
 
 
946 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  31.02 
 
 
959 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  46.32 
 
 
591 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  33.16 
 
 
973 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  39.02 
 
 
877 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  46.08 
 
 
591 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  32.95 
 
 
973 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  45.99 
 
 
601 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  32.48 
 
 
928 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  42.05 
 
 
658 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  45.63 
 
 
601 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  31.87 
 
 
956 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  32.46 
 
 
948 aa  376  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  32.65 
 
 
973 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  45.63 
 
 
601 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  31.3 
 
 
950 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  39.82 
 
 
618 aa  354  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  42.48 
 
 
948 aa  317  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  31.79 
 
 
953 aa  308  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  38.38 
 
 
493 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  38.59 
 
 
493 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  38.59 
 
 
493 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  29.91 
 
 
954 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  39.05 
 
 
481 aa  282  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  38.52 
 
 
1085 aa  269  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  32.53 
 
 
906 aa  269  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  41.15 
 
 
502 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  31.34 
 
 
922 aa  265  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  38.63 
 
 
468 aa  265  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
1085 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
1137 aa  255  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 
781 aa  254  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  38.55 
 
 
1066 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  43.36 
 
 
1072 aa  252  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  36.74 
 
 
999 aa  251  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  40 
 
 
887 aa  251  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  38.19 
 
 
1087 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  30.45 
 
 
901 aa  248  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  34.16 
 
 
490 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  39.26 
 
 
1119 aa  246  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  39.18 
 
 
1050 aa  245  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 
886 aa  244  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  38.67 
 
 
792 aa  242  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  39.05 
 
 
1094 aa  243  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  43.6 
 
 
1042 aa  242  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  35.63 
 
 
701 aa  242  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
882 aa  239  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  41.44 
 
 
1017 aa  237  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  36.27 
 
 
1049 aa  237  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  37.98 
 
 
1056 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  40.59 
 
 
1058 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  38.05 
 
 
799 aa  234  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  40.57 
 
 
824 aa  233  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.8 
 
 
1055 aa  227  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  28.29 
 
 
888 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 
816 aa  226  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.43 
 
 
1125 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  36.15 
 
 
840 aa  225  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  28.62 
 
 
975 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 
1100 aa  224  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.02 
 
 
1092 aa  221  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  35.36 
 
 
765 aa  221  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 
931 aa  221  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  37.44 
 
 
760 aa  220  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.28 
 
 
1036 aa  218  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.18 
 
 
1102 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
775 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  36.86 
 
 
1058 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  37.01 
 
 
1060 aa  212  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  34.03 
 
 
960 aa  210  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
814 aa  209  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  32.6 
 
 
504 aa  210  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  40.51 
 
 
1093 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.5 
 
 
1043 aa  209  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  38.39 
 
 
916 aa  208  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  35.95 
 
 
1103 aa  208  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 
768 aa  207  8e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.38 
 
 
943 aa  206  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  33.89 
 
 
776 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  33.48 
 
 
827 aa  204  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  36.18 
 
 
1110 aa  204  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
393 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  33.74 
 
 
1064 aa  203  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.94 
 
 
957 aa  202  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  37.47 
 
 
919 aa  201  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.58 
 
 
952 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 
901 aa  199  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 
755 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  34.03 
 
 
818 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  34.48 
 
 
951 aa  198  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 
969 aa  196  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 
1227 aa  194  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>