More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2898 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 1094 aa  2100    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  45.83 
 
 		 1087 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40.22 
 
 		 1100 aa  526  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 1042 aa  522  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  39.94 
 
 		 1050 aa  515  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  42.38 
 
 		 1058 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  41.88 
 
 		 1072 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  39.33 
 
 		 1056 aa  491  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 1066 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  43.97 
 
 		 1110 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 1058 aa  476  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  41.21 
 
 		 1097 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  42.41 
 
 		 1036 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  41.58 
 
 		 1093 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 1049 aa  455  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  40.47 
 
 		 1043 aa  445  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  40.33 
 
 		 1060 aa  438  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 1082 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.72 
 
 		 1092 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  42.08 
 
 		 1125 aa  416  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  39.22 
 
 		 1102 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  37.72 
 
 		 1048 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.57 
 
 		 1017 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  42.84 
 
 		 1055 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.1 
 
 		 1103 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  39.79 
 
 		 1028 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 957 aa  369  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  37.43 
 
 		 1005 aa  355  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  39.27 
 
 		 969 aa  345  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  43.63 
 
 		 922 aa  340  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  40.95 
 
 		 960 aa  338  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 952 aa  328  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 1158 aa  323  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 1227 aa  304  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 943 aa  303  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  33.13 
 
 		 1018 aa  295  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  48.29 
 
 		 1186 aa  288  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  35.8 
 
 		 999 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  36.12 
 
 		 1064 aa  284  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  41.81 
 
 		 824 aa  280  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 781 aa  277  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  38.17 
 
 		 1005 aa  272  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  38.96 
 
 		 1085 aa  268  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  37.03 
 
 		 963 aa  265  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  34.83 
 
 		 792 aa  264  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  36.48 
 
 		 1131 aa  263  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 980 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 950 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  36.98 
 
 		 840 aa  253  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 941 aa  251  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 882 aa  251  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 886 aa  250  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  37.48 
 
 		 799 aa  249  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  35.54 
 
 		 816 aa  248  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 1137 aa  245  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  44.47 
 
 		 775 aa  245  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 1085 aa  243  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  41.83 
 
 		 887 aa  239  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 1034 aa  239  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  34 
 
 		 943 aa  238  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  34.25 
 
 		 1076 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  41.63 
 
 		 1119 aa  236  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  37.73 
 
 		 916 aa  233  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 1049 aa  233  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 765 aa  231  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  35.13 
 
 		 701 aa  229  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  38.85 
 
 		 1100 aa  228  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  37.64 
 
 		 1161 aa  228  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  42.82 
 
 		 973 aa  226  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  38.24 
 
 		 760 aa  225  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  42.82 
 
 		 973 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 1079 aa  224  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 921 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 779 aa  218  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 818 aa  217  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  39.95 
 
 		 877 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  42.51 
 
 		 755 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 901 aa  214  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  40.61 
 
 		 601 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 591 aa  214  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  40.46 
 
 		 948 aa  213  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  43.41 
 
 		 591 aa  212  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  38.36 
 
 		 776 aa  212  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 948 aa  211  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  34.12 
 
 		 1060 aa  211  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 1010 aa  211  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  38.52 
 
 		 972 aa  207  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  40.39 
 
 		 601 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  40.39 
 
 		 601 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  39.33 
 
 		 827 aa  205  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  40.15 
 
 		 1001 aa  206  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  31.81 
 
 		 831 aa  204  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  35.64 
 
 		 678 aa  203  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 812 aa  202  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  36.02 
 
 		 953 aa  201  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 906 aa  199  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 658 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 814 aa  199  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  39.11 
 
 		 973 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 630 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>