More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2207 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
901 aa  1797    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  33.04 
 
 
816 aa  365  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 
910 aa  337  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
799 aa  325  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  35.93 
 
 
975 aa  322  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  32.55 
 
 
812 aa  311  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  36.6 
 
 
768 aa  303  8.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  31.53 
 
 
872 aa  285  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  30.49 
 
 
1125 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.24 
 
 
999 aa  274  6e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  37.12 
 
 
916 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  34.11 
 
 
804 aa  268  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
781 aa  267  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  31.68 
 
 
888 aa  263  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 
831 aa  263  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
726 aa  258  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
775 aa  257  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  30.61 
 
 
1103 aa  257  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  31.84 
 
 
792 aa  256  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  32.76 
 
 
886 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  31.95 
 
 
802 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 
736 aa  246  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  31.52 
 
 
701 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  29.8 
 
 
1092 aa  245  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  29.36 
 
 
1119 aa  244  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  31.79 
 
 
1085 aa  238  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  29.93 
 
 
1227 aa  238  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  30.88 
 
 
1102 aa  237  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  30.12 
 
 
824 aa  237  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  30.45 
 
 
797 aa  236  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  31.92 
 
 
779 aa  235  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  33.6 
 
 
960 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 
818 aa  232  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  30.36 
 
 
1087 aa  231  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  30.49 
 
 
1056 aa  231  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.55 
 
 
1056 aa  228  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  31.45 
 
 
1017 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  35.12 
 
 
877 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
814 aa  225  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  30.32 
 
 
799 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  28.77 
 
 
996 aa  222  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
798 aa  222  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  30.61 
 
 
827 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  28.68 
 
 
1097 aa  221  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  35.71 
 
 
1072 aa  221  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
1085 aa  221  7e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  34.02 
 
 
776 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
1137 aa  218  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 
1066 aa  217  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  32.49 
 
 
882 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 
1100 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  31.53 
 
 
840 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 
729 aa  210  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  32.3 
 
 
755 aa  210  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  36.47 
 
 
887 aa  210  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  31.62 
 
 
957 aa  209  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  28.73 
 
 
1049 aa  208  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  31.91 
 
 
1050 aa  209  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  32.36 
 
 
1055 aa  207  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  31.65 
 
 
972 aa  207  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  31.04 
 
 
966 aa  204  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  31.61 
 
 
952 aa  204  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  32.7 
 
 
780 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  31.91 
 
 
921 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  32.48 
 
 
1042 aa  202  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  33.89 
 
 
1043 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  32.38 
 
 
1058 aa  201  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  31.69 
 
 
1005 aa  201  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  31.8 
 
 
1058 aa  200  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  34.11 
 
 
1110 aa  198  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  33.81 
 
 
1036 aa  198  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  34.75 
 
 
601 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  31.63 
 
 
678 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 
1014 aa  194  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  35 
 
 
601 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  35 
 
 
601 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  34.5 
 
 
618 aa  191  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  29.95 
 
 
1010 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  29.89 
 
 
950 aa  192  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 
878 aa  189  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  32.78 
 
 
1001 aa  188  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  28.64 
 
 
1018 aa  188  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  31.21 
 
 
1131 aa  187  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  34.25 
 
 
591 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 
1093 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 
1094 aa  185  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.56 
 
 
1104 aa  185  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  34.57 
 
 
973 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  31.64 
 
 
658 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  28.88 
 
 
928 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  30.65 
 
 
765 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  29.81 
 
 
961 aa  181  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  26.72 
 
 
777 aa  180  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  33.42 
 
 
591 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  31.66 
 
 
943 aa  177  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
393 aa  177  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  36.77 
 
 
490 aa  177  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  33.08 
 
 
953 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  29.81 
 
 
644 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  32.74 
 
 
931 aa  175  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>