More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4464 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 1082 aa  2081    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  59.21 
 
 		 1005 aa  919    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 1093 aa  596  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  39.8 
 
 		 1100 aa  558  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 1042 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  37.69 
 
 		 1066 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  39.68 
 
 		 1060 aa  486  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 1058 aa  483  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  37.28 
 
 		 1050 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  39.08 
 
 		 1048 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.35 
 
 		 1056 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  38.55 
 
 		 1087 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  36.59 
 
 		 1049 aa  466  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  40.67 
 
 		 1058 aa  462  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  39.15 
 
 		 1072 aa  459  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 1043 aa  456  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.02 
 
 		 1110 aa  445  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 1097 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  38.3 
 
 		 1028 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.65 
 
 		 1125 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  38.33 
 
 		 1036 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  34.64 
 
 		 1092 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.2 
 
 		 1094 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.14 
 
 		 1102 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  38.86 
 
 		 960 aa  355  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  35.81 
 
 		 1103 aa  349  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.07 
 
 		 1055 aa  348  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  34.06 
 
 		 1017 aa  347  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  39.31 
 
 		 1158 aa  322  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 957 aa  322  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.64 
 
 		 969 aa  322  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.48 
 
 		 952 aa  316  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 1186 aa  312  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  38.59 
 
 		 943 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  36.26 
 
 		 1018 aa  297  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 922 aa  295  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.69 
 
 		 1227 aa  292  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  35.14 
 
 		 1131 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  38.03 
 
 		 792 aa  271  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  36.58 
 
 		 701 aa  269  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  31.25 
 
 		 999 aa  268  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 775 aa  264  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  35.43 
 
 		 1064 aa  264  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  40.23 
 
 		 1085 aa  261  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  37.15 
 
 		 1049 aa  261  7e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 781 aa  260  8e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.74 
 
 		 840 aa  259  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  34.04 
 
 		 824 aa  254  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  35.05 
 
 		 1076 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  40.27 
 
 		 886 aa  248  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 980 aa  246  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 1085 aa  244  9e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 1137 aa  243  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  39.47 
 
 		 1119 aa  242  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  38.37 
 
 		 1100 aa  241  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  32.16 
 
 		 1060 aa  237  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 963 aa  234  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  33.58 
 
 		 941 aa  233  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  36.24 
 
 		 1027 aa  231  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  35.3 
 
 		 1161 aa  230  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  37.8 
 
 		 779 aa  230  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  37.64 
 
 		 765 aa  230  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  37.15 
 
 		 780 aa  229  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  34.08 
 
 		 799 aa  228  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  34.25 
 
 		 943 aa  228  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.99 
 
 		 760 aa  227  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  36.16 
 
 		 916 aa  224  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 1079 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 1034 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  35.12 
 
 		 1005 aa  221  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 814 aa  219  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  35.04 
 
 		 630 aa  219  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  39.28 
 
 		 1010 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  39.49 
 
 		 887 aa  216  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 972 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  38.5 
 
 		 776 aa  212  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 921 aa  211  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 755 aa  211  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 658 aa  211  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 882 aa  210  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 816 aa  209  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  31.89 
 
 		 888 aa  207  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  37.15 
 
 		 678 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 591 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.27 
 
 		 1104 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 591 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 1001 aa  202  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  33.62 
 
 		 777 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 1064 aa  198  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  33.61 
 
 		 827 aa  196  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  32.8 
 
 		 950 aa  196  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.8 
 
 		 966 aa  194  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  40.23 
 
 		 418 aa  195  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  37.91 
 
 		 1141 aa  194  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 490 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 831 aa  194  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 928 aa  193  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01160  predicted ATPase  31.7 
 
 		 892 aa  193  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 601 aa  193  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 818 aa  191  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>