More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6569 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  100 
 
 		 1027 aa  1953    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 957 aa  343  9e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 952 aa  294  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 		 969 aa  292  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  36.93 
 
 		 1058 aa  290  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.05 
 
 		 1110 aa  289  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.06 
 
 		 1056 aa  284  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.67 
 
 		 1102 aa  282  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  35.48 
 
 		 1092 aa  281  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  37.83 
 
 		 1050 aa  280  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 1100 aa  275  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  35.55 
 
 		 1042 aa  272  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  36.05 
 
 		 1087 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  37.66 
 
 		 1072 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 1043 aa  265  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  34.68 
 
 		 960 aa  261  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 1097 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 943 aa  259  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  36.71 
 
 		 1049 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  35.97 
 
 		 1093 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  36.38 
 
 		 1094 aa  254  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.04 
 
 		 1036 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  36.38 
 
 		 1066 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 941 aa  247  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  35.74 
 
 		 963 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  35.83 
 
 		 1103 aa  244  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  34.93 
 
 		 1017 aa  244  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  36.43 
 
 		 922 aa  243  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  34.2 
 
 		 1058 aa  241  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  36.78 
 
 		 1055 aa  240  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 1082 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  36.38 
 
 		 1158 aa  237  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 980 aa  235  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.52 
 
 		 1125 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.91 
 
 		 943 aa  228  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  32.8 
 
 		 1018 aa  228  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  30.74 
 
 		 999 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  38.13 
 
 		 1005 aa  214  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  35.74 
 
 		 1060 aa  214  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  35.39 
 
 		 1064 aa  204  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  39.18 
 
 		 1186 aa  204  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 781 aa  202  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  39.35 
 
 		 840 aa  202  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  33.68 
 
 		 1131 aa  197  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  38.44 
 
 		 1005 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  42.4 
 
 		 878 aa  194  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.82 
 
 		 981 aa  191  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  37.77 
 
 		 1085 aa  191  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  43.08 
 
 		 907 aa  190  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  37.42 
 
 		 1028 aa  189  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  34.47 
 
 		 1048 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  38.19 
 
 		 1119 aa  185  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 601 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  43.08 
 
 		 982 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  43.92 
 
 		 886 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  36.74 
 
 		 877 aa  180  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  34.53 
 
 		 972 aa  179  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  36.9 
 
 		 950 aa  179  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 921 aa  178  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 		 1100 aa  178  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 591 aa  178  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.33 
 
 		 934 aa  178  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  35.94 
 
 		 1010 aa  177  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  39.17 
 
 		 601 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  39.17 
 
 		 601 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  38.48 
 
 		 1141 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 966 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 765 aa  175  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  39.09 
 
 		 591 aa  175  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  32.36 
 
 		 630 aa  174  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  35.95 
 
 		 792 aa  174  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 1137 aa  173  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  37.97 
 
 		 755 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.88 
 
 		 1227 aa  172  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 1001 aa  171  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 887 aa  171  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  33.74 
 
 		 950 aa  171  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 953 aa  170  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.59 
 
 		 1108 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  31.6 
 
 		 630 aa  169  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  39.94 
 
 		 973 aa  170  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 775 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.94 
 
 		 973 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  31.9 
 
 		 701 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  33.47 
 
 		 922 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  38.02 
 
 		 916 aa  167  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  35.81 
 
 		 906 aa  167  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  40.06 
 
 		 948 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 910 aa  166  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  33 
 
 		 1049 aa  165  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 1085 aa  164  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  29.31 
 
 		 931 aa  164  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.52 
 
 		 816 aa  164  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  35.01 
 
 		 961 aa  164  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 973 aa  164  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  32.82 
 
 		 990 aa  162  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  38.74 
 
 		 948 aa  162  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  34.13 
 
 		 760 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  34.24 
 
 		 824 aa  161  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 812 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>