More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4552 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  100 
 
 		 1043 aa  2019    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  41.01 
 
 		 1100 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  43.1 
 
 		 1072 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 1093 aa  519  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 		 1042 aa  497  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.35 
 
 		 1058 aa  495  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  39.9 
 
 		 1066 aa  496  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 1058 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  39.29 
 
 		 1056 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 1049 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  39.39 
 
 		 1050 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.69 
 
 		 1125 aa  459  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  47.38 
 
 		 1036 aa  459  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  37.15 
 
 		 1097 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  37.91 
 
 		 1087 aa  445  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  38.63 
 
 		 1060 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  38.42 
 
 		 1048 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  37.38 
 
 		 1110 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 1082 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  42.84 
 
 		 1102 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.47 
 
 		 1092 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  40.14 
 
 		 1055 aa  403  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.61 
 
 		 1103 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  41.04 
 
 		 1017 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  40.23 
 
 		 1094 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  45.35 
 
 		 922 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  39.93 
 
 		 1028 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.72 
 
 		 960 aa  364  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  34.52 
 
 		 1018 aa  362  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 957 aa  343  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 1158 aa  343  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  38.63 
 
 		 969 aa  337  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  37.85 
 
 		 1005 aa  332  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  35.88 
 
 		 952 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  38.07 
 
 		 1227 aa  328  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  39.05 
 
 		 1005 aa  327  6e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  35.21 
 
 		 999 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  48.13 
 
 		 1186 aa  298  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.14 
 
 		 943 aa  292  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 781 aa  281  6e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  41.86 
 
 		 792 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  36.4 
 
 		 980 aa  271  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  43.34 
 
 		 799 aa  270  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  35.99 
 
 		 1085 aa  266  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  34.15 
 
 		 1131 aa  266  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  40.35 
 
 		 824 aa  266  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  36.91 
 
 		 963 aa  261  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  42.04 
 
 		 1119 aa  261  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  35.86 
 
 		 941 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  38.62 
 
 		 701 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  34.39 
 
 		 1064 aa  259  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  43.29 
 
 		 886 aa  259  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 775 aa  258  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  32.92 
 
 		 1049 aa  254  7e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.16 
 
 		 840 aa  253  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 1137 aa  248  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  39.82 
 
 		 972 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  40.57 
 
 		 887 aa  241  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  37.5 
 
 		 760 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  35.75 
 
 		 816 aa  235  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 1076 aa  231  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 1085 aa  229  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  35.41 
 
 		 1100 aa  229  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  39.82 
 
 		 765 aa  228  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  35.22 
 
 		 1161 aa  227  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  36.79 
 
 		 776 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  32.46 
 
 		 630 aa  224  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  40.97 
 
 		 877 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 966 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 882 aa  222  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 1034 aa  222  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  37.06 
 
 		 678 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  42.33 
 
 		 601 aa  221  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  42.38 
 
 		 658 aa  221  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 901 aa  221  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 921 aa  220  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 1079 aa  220  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  35.83 
 
 		 780 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  42.09 
 
 		 601 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  42.09 
 
 		 601 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  37.34 
 
 		 779 aa  217  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 393 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 1064 aa  216  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  38.43 
 
 		 950 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  30.5 
 
 		 1060 aa  216  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  41.08 
 
 		 591 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  41.46 
 
 		 973 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 591 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  33.56 
 
 		 777 aa  215  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  39.37 
 
 		 755 aa  214  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  32.34 
 
 		 943 aa  213  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 973 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.72 
 
 		 916 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 812 aa  210  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 948 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 973 aa  209  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 928 aa  208  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 814 aa  208  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 1001 aa  208  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  39.49 
 
 		 931 aa  207  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>