More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6374 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  65.97 
 
 		 1058 aa  1239    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  59.79 
 
 		 1050 aa  1162    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 1042 aa  2036    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  41.6 
 
 		 1087 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  41.52 
 
 		 1056 aa  591  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  40.78 
 
 		 1072 aa  542  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 1066 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  38.97 
 
 		 1097 aa  531  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.76 
 
 		 1100 aa  528  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  41.09 
 
 		 1036 aa  525  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 1049 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  42.82 
 
 		 1110 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.49 
 
 		 1125 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 1058 aa  499  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 1043 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  41 
 
 		 1093 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 1094 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 1082 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  41.06 
 
 		 1092 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.18 
 
 		 1103 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  38.75 
 
 		 1060 aa  452  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.45 
 
 		 1017 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.92 
 
 		 1102 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.11 
 
 		 1055 aa  442  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  34.96 
 
 		 1048 aa  396  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 1028 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  42.78 
 
 		 1158 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.76 
 
 		 957 aa  383  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  36.9 
 
 		 1005 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  37.16 
 
 		 922 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 952 aa  358  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  38.64 
 
 		 960 aa  348  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.77 
 
 		 969 aa  325  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  48.5 
 
 		 1186 aa  322  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  33.8 
 
 		 1018 aa  319  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.74 
 
 		 943 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  36.82 
 
 		 1131 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  37.98 
 
 		 1005 aa  307  7e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  36.89 
 
 		 1064 aa  302  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  29.6 
 
 		 999 aa  299  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 781 aa  294  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  38.36 
 
 		 701 aa  291  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  37.17 
 
 		 886 aa  289  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 1227 aa  288  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  38.77 
 
 		 980 aa  287  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  36.42 
 
 		 963 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  35.28 
 
 		 824 aa  285  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  41.27 
 
 		 792 aa  285  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  37.03 
 
 		 941 aa  281  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  40.61 
 
 		 1085 aa  278  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  43.12 
 
 		 1119 aa  266  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 775 aa  266  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.57 
 
 		 840 aa  261  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  42 
 
 		 799 aa  260  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  39.05 
 
 		 1049 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 816 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 1137 aa  251  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  36.88 
 
 		 818 aa  251  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 887 aa  249  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.07 
 
 		 943 aa  249  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  43.42 
 
 		 1001 aa  248  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  41.15 
 
 		 972 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  40.57 
 
 		 765 aa  245  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 882 aa  245  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 831 aa  244  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 921 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.19 
 
 		 916 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 1161 aa  241  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  36.46 
 
 		 950 aa  241  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  40.41 
 
 		 966 aa  240  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  35.93 
 
 		 1100 aa  239  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 1085 aa  238  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 1079 aa  238  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 1034 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 814 aa  235  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  42.58 
 
 		 658 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  36.81 
 
 		 1076 aa  234  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  42.93 
 
 		 1010 aa  234  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  44.94 
 
 		 601 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 1027 aa  233  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 1064 aa  231  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  45.92 
 
 		 591 aa  231  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  41.48 
 
 		 877 aa  231  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  44.94 
 
 		 601 aa  231  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  44.94 
 
 		 601 aa  231  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.05 
 
 		 760 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  46.04 
 
 		 591 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  38.71 
 
 		 678 aa  228  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 393 aa  228  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  37.97 
 
 		 776 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  36.73 
 
 		 827 aa  224  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  33.83 
 
 		 1044 aa  221  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  34.19 
 
 		 777 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  41.76 
 
 		 878 aa  218  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  30.92 
 
 		 975 aa  215  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  40.23 
 
 		 961 aa  214  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  36.83 
 
 		 922 aa  213  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 973 aa  212  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  36.53 
 
 		 779 aa  212  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  31.4 
 
 		 1060 aa  211  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>