240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1058 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  100 
 
 		 678 aa  1330    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  41.68 
 
 		 701 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  45.52 
 
 		 644 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1065  ATPase-like protein  41.38 
 
 		 649 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.444255  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  42.61 
 
 		 776 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  38.42 
 
 		 792 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  40.41 
 
 		 960 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  39.38 
 
 		 840 aa  341  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 814 aa  332  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 775 aa  326  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  44.52 
 
 		 760 aa  309  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  36.27 
 
 		 780 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 755 aa  299  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  42.13 
 
 		 1085 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 1137 aa  258  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  42.66 
 
 		 1102 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.06 
 
 		 999 aa  253  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 1085 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  34.2 
 
 		 824 aa  242  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 886 aa  239  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 882 aa  239  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  40.14 
 
 		 1050 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  39.35 
 
 		 1125 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  40.09 
 
 		 1119 aa  238  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  39.1 
 
 		 1087 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  32.53 
 
 		 777 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  33.62 
 
 		 765 aa  233  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  39.56 
 
 		 887 aa  233  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  42.46 
 
 		 1058 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.99 
 
 		 1092 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.17 
 
 		 1017 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 781 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  39.4 
 
 		 1042 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  40.65 
 
 		 1227 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  37.75 
 
 		 1056 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  48.09 
 
 		 969 aa  219  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.4 
 
 		 816 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  38.85 
 
 		 1066 aa  217  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.65 
 
 		 1100 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  33.69 
 
 		 957 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  32.98 
 
 		 799 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.57 
 
 		 1110 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 1093 aa  213  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.06 
 
 		 1043 aa  212  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  36.23 
 
 		 1049 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.02 
 
 		 952 aa  210  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 393 aa  208  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  37.24 
 
 		 931 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.2 
 
 		 1055 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 901 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.22 
 
 		 1103 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  39.26 
 
 		 943 aa  198  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  33.11 
 
 		 1018 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.4 
 
 		 1097 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 818 aa  190  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  35.01 
 
 		 1094 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 1082 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 831 aa  188  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  34.49 
 
 		 950 aa  187  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  41.34 
 
 		 1158 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  41.16 
 
 		 951 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  33.25 
 
 		 877 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  34.62 
 
 		 916 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 921 aa  184  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  34.27 
 
 		 972 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  32.98 
 
 		 907 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.72 
 
 		 1036 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 928 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  30.02 
 
 		 975 aa  180  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  31.38 
 
 		 982 aa  180  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 938 aa  180  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  39.84 
 
 		 919 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  30.8 
 
 		 888 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  42.9 
 
 		 418 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  38.54 
 
 		 1072 aa  177  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 1076 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  29.79 
 
 		 827 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  34.08 
 
 		 768 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  31.19 
 
 		 1056 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 1034 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 		 953 aa  174  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 601 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  34.28 
 
 		 1010 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  33.71 
 
 		 1058 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 906 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 910 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 591 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  36.15 
 
 		 601 aa  170  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  36.15 
 
 		 601 aa  170  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  35.2 
 
 		 1060 aa  170  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  37.87 
 
 		 878 aa  170  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 736 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 966 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 948 aa  168  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 779 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 591 aa  167  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 973 aa  164  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 812 aa  164  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 1049 aa  163  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2078  transcriptional regulator, LuxR family  35.95 
 
 		 940 aa  161  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.9735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>