More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3287 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  92.92 
 
 		 1064 aa  1768    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  100 
 
 		 1044 aa  2067    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  34.5 
 
 		 991 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  31.61 
 
 		 1145 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 992 aa  322  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 1050 aa  317  7e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  36.89 
 
 		 996 aa  311  5.9999999999999995e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  29.62 
 
 		 999 aa  259  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  33.98 
 
 		 1058 aa  237  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 799 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.57 
 
 		 1104 aa  234  7.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  33.69 
 
 		 1042 aa  230  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  30.35 
 
 		 1092 aa  227  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  27.8 
 
 		 816 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  33.29 
 
 		 1066 aa  220  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  29.73 
 
 		 1125 aa  216  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  30.33 
 
 		 1056 aa  211  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  32.07 
 
 		 957 aa  211  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  35.28 
 
 		 1110 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 952 aa  204  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 1043 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  35 
 
 		 1036 aa  202  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  32.4 
 
 		 1050 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  28.99 
 
 		 1018 aa  201  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  28.59 
 
 		 1097 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  31.65 
 
 		 1087 aa  198  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  32.55 
 
 		 1100 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  32.8 
 
 		 1058 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  29.65 
 
 		 1102 aa  189  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  30.15 
 
 		 1056 aa  187  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 910 aa  186  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  32.59 
 
 		 888 aa  185  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  28.35 
 
 		 1103 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  31.87 
 
 		 1072 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  31.83 
 
 		 768 aa  183  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  29.83 
 
 		 960 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  29.46 
 
 		 1055 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  29.55 
 
 		 824 aa  181  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  32.9 
 
 		 1093 aa  181  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 1049 aa  179  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 1082 aa  178  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  28.18 
 
 		 797 aa  177  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 		 886 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 812 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 901 aa  177  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 726 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  29.43 
 
 		 1227 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  28.93 
 
 		 701 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  35.47 
 
 		 916 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  30.22 
 
 		 943 aa  169  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  31.11 
 
 		 1017 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  34.64 
 
 		 1085 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 802 aa  169  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  29.22 
 
 		 792 aa  168  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  34.44 
 
 		 1064 aa  167  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  36.49 
 
 		 827 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  30.78 
 
 		 1158 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 775 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  28.24 
 
 		 969 aa  166  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  28.14 
 
 		 975 aa  166  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 781 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  41.22 
 
 		 919 aa  163  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  33.74 
 
 		 618 aa  162  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 831 aa  162  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  34.87 
 
 		 840 aa  160  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 818 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 882 aa  159  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 1137 aa  159  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  31.43 
 
 		 922 aa  159  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  37.05 
 
 		 928 aa  157  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  30.08 
 
 		 779 aa  157  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  38.07 
 
 		 765 aa  155  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 814 aa  154  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 887 aa  154  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 973 aa  152  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  32.21 
 
 		 943 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  29.33 
 
 		 799 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 872 aa  146  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 972 aa  146  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  36.86 
 
 		 938 aa  145  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  27.58 
 
 		 798 aa  145  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 922 aa  144  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  29.64 
 
 		 1005 aa  144  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  35.41 
 
 		 1119 aa  145  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 1186 aa  144  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 963 aa  144  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  35.04 
 
 		 950 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  33.41 
 
 		 630 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  32.77 
 
 		 956 aa  142  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 490 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  32.14 
 
 		 1060 aa  141  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  32.11 
 
 		 1014 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 931 aa  140  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  31.54 
 
 		 921 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 959 aa  140  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 393 aa  139  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  30.15 
 
 		 1131 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 1071 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  35.74 
 
 		 760 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  29.92 
 
 		 980 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>