More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1245 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  57.18 
 
 		 1092 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 1158 aa  2229    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  48.51 
 
 		 1125 aa  854    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  44.47 
 
 		 1055 aa  676    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  52.21 
 
 		 1102 aa  591  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  52.9 
 
 		 1017 aa  576  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  43.93 
 
 		 1103 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  42.69 
 
 		 1042 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 957 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  43.76 
 
 		 1110 aa  399  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.97 
 
 		 1058 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  41.36 
 
 		 1087 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  37.63 
 
 		 1050 aa  380  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  39.51 
 
 		 1058 aa  376  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 1100 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  40.14 
 
 		 1036 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 1093 aa  366  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  38.49 
 
 		 1043 aa  364  7.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  37.8 
 
 		 1097 aa  358  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 969 aa  352  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  39.28 
 
 		 1066 aa  347  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.08 
 
 		 960 aa  343  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  39.69 
 
 		 1048 aa  329  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.19 
 
 		 952 aa  324  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  37.18 
 
 		 1049 aa  318  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 1082 aa  316  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  37.83 
 
 		 1060 aa  315  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  39.86 
 
 		 1072 aa  311  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 1005 aa  310  6.999999999999999e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  37.18 
 
 		 1018 aa  306  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  38.9 
 
 		 922 aa  304  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  40.48 
 
 		 1028 aa  300  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 1227 aa  290  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  35.17 
 
 		 943 aa  282  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  44.39 
 
 		 792 aa  278  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 781 aa  264  6.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  37.67 
 
 		 980 aa  260  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  45.12 
 
 		 840 aa  259  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  43.95 
 
 		 1085 aa  253  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  35.98 
 
 		 963 aa  252  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  42.47 
 
 		 1056 aa  248  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  44.82 
 
 		 1137 aa  247  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  36.86 
 
 		 1131 aa  245  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 1186 aa  245  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 775 aa  244  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  48.3 
 
 		 886 aa  243  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.29 
 
 		 999 aa  243  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  40.64 
 
 		 824 aa  237  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 941 aa  234  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  38.07 
 
 		 701 aa  234  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  33.8 
 
 		 1064 aa  233  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  40.05 
 
 		 814 aa  227  9e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  39.34 
 
 		 760 aa  227  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  41.13 
 
 		 972 aa  226  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  43.25 
 
 		 799 aa  225  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  33.71 
 
 		 943 aa  225  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 921 aa  221  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 887 aa  220  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  41.44 
 
 		 765 aa  216  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  41.09 
 
 		 678 aa  217  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  33.69 
 
 		 1049 aa  216  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 882 aa  215  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 1085 aa  215  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  41.87 
 
 		 1119 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  42.06 
 
 		 818 aa  212  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 1076 aa  207  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  40.84 
 
 		 755 aa  207  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  34.63 
 
 		 1100 aa  206  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 1094 aa  205  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  40.16 
 
 		 827 aa  204  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.72 
 
 		 816 aa  204  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  36.88 
 
 		 776 aa  202  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  40.83 
 
 		 591 aa  201  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  41.11 
 
 		 591 aa  201  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  42.59 
 
 		 1060 aa  200  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  32.8 
 
 		 981 aa  198  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  40.75 
 
 		 950 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  39 
 
 		 780 aa  197  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 		 990 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 1010 aa  196  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  40.1 
 
 		 601 aa  195  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 799 aa  194  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 1005 aa  194  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 878 aa  194  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  32.34 
 
 		 630 aa  193  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 630 aa  194  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.87 
 
 		 966 aa  193  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  40.73 
 
 		 948 aa  193  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.91 
 
 		 877 aa  190  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  40.33 
 
 		 1161 aa  190  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 1001 aa  190  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.39 
 
 		 916 aa  191  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 901 aa  190  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 1014 aa  189  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 888 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  37.47 
 
 		 928 aa  189  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 931 aa  189  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  39.78 
 
 		 948 aa  188  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  28.97 
 
 		 991 aa  187  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  38.76 
 
 		 1141 aa  187  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>