More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1930 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 		 991 aa  1988    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  34.2 
 
 		 1044 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 1064 aa  364  4e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  28.89 
 
 		 1145 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 1050 aa  274  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  28.86 
 
 		 996 aa  265  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  27.38 
 
 		 992 aa  251  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  27.68 
 
 		 999 aa  218  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.49 
 
 		 1104 aa  205  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 799 aa  197  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  25.24 
 
 		 816 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  27.32 
 
 		 1125 aa  190  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 957 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  28.67 
 
 		 1103 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 888 aa  184  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  26.74 
 
 		 1092 aa  181  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  28.79 
 
 		 1158 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 901 aa  174  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  28.43 
 
 		 1102 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  30.35 
 
 		 768 aa  166  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  26.37 
 
 		 1056 aa  166  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 798 aa  163  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  27.6 
 
 		 975 aa  163  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  27.46 
 
 		 1227 aa  162  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  28.89 
 
 		 799 aa  159  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  28.42 
 
 		 1017 aa  159  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 		 779 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  27.06 
 
 		 1058 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  25.46 
 
 		 1018 aa  157  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  28.43 
 
 		 969 aa  156  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  30.64 
 
 		 1058 aa  156  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  27.76 
 
 		 1056 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  32.56 
 
 		 1066 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  34 
 
 		 840 aa  153  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  27.4 
 
 		 1097 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  26.55 
 
 		 824 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  27.17 
 
 		 701 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  30.18 
 
 		 1050 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  27.37 
 
 		 1093 aa  150  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  27.57 
 
 		 1042 aa  150  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  34.63 
 
 		 886 aa  148  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  28.92 
 
 		 952 aa  148  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 812 aa  147  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  28.52 
 
 		 961 aa  147  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  31.59 
 
 		 916 aa  147  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  28.66 
 
 		 1055 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  28.06 
 
 		 1085 aa  145  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  33.07 
 
 		 973 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  31.28 
 
 		 760 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  34.4 
 
 		 973 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  30.62 
 
 		 956 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  32.87 
 
 		 943 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  29.65 
 
 		 921 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  30.41 
 
 		 1110 aa  142  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 802 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  31.19 
 
 		 1087 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 882 aa  138  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 973 aa  139  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 1082 aa  138  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  30.34 
 
 		 1036 aa  138  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 591 aa  137  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  29.52 
 
 		 943 aa  137  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 601 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  27.26 
 
 		 1043 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 950 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 872 aa  135  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 736 aa  135  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 781 aa  135  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  34.28 
 
 		 502 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 910 aa  135  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 1085 aa  134  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 591 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  25.86 
 
 		 792 aa  134  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  30 
 
 		 618 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 972 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  30.66 
 
 		 1014 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 601 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 601 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 877 aa  132  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  26.24 
 
 		 960 aa  131  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  31.72 
 
 		 765 aa  131  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  27.88 
 
 		 950 aa  131  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  34.63 
 
 		 938 aa  130  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  29.8 
 
 		 966 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 831 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 1137 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 928 aa  129  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 		 726 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  32.27 
 
 		 887 aa  129  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 948 aa  127  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  27.71 
 
 		 1049 aa  126  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  35.12 
 
 		 948 aa  126  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  26.33 
 
 		 1005 aa  126  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  30.6 
 
 		 630 aa  126  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  33.55 
 
 		 755 aa  125  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 959 aa  125  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 490 aa  125  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  27.3 
 
 		 922 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  33.75 
 
 		 827 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  33.63 
 
 		 919 aa  122  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>