More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3228 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 726 aa  1483    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  38.93 
 
 		 797 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 736 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  34.64 
 
 		 816 aa  343  8e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 		 729 aa  310  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 910 aa  266  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 901 aa  258  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  30.14 
 
 		 999 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  28.89 
 
 		 975 aa  251  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 872 aa  251  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 888 aa  246  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 799 aa  244  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  30.82 
 
 		 768 aa  235  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 812 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  31.45 
 
 		 779 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  31.53 
 
 		 1085 aa  220  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 1085 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 804 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  28.63 
 
 		 1092 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  26.37 
 
 		 701 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 802 aa  211  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  31.14 
 
 		 1102 aa  209  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  29.51 
 
 		 1125 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 781 aa  208  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  29.08 
 
 		 1103 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 831 aa  200  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 798 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  27.69 
 
 		 792 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  30.07 
 
 		 1227 aa  198  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  31.8 
 
 		 916 aa  197  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  30.98 
 
 		 960 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  28.91 
 
 		 1119 aa  196  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 882 aa  195  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  26.62 
 
 		 824 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  32.26 
 
 		 1066 aa  190  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  28.64 
 
 		 1056 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  31.06 
 
 		 957 aa  189  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 775 aa  187  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 1137 aa  187  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  30.81 
 
 		 1005 aa  184  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  29.33 
 
 		 1056 aa  184  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  32.63 
 
 		 840 aa  183  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.01 
 
 		 1104 aa  182  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  28.65 
 
 		 799 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  30.83 
 
 		 1097 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 887 aa  179  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  31.51 
 
 		 1087 aa  178  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  27.95 
 
 		 886 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  29.52 
 
 		 1055 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  31.7 
 
 		 877 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 972 aa  172  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 966 aa  170  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  28.04 
 
 		 1017 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  31.08 
 
 		 1010 aa  170  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  28.74 
 
 		 776 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 952 aa  168  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  29.98 
 
 		 928 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  27.33 
 
 		 760 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  32.13 
 
 		 969 aa  161  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  29.98 
 
 		 658 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  31.13 
 
 		 1094 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  26.51 
 
 		 996 aa  158  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  29.91 
 
 		 1050 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  29.2 
 
 		 755 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  27.49 
 
 		 950 aa  157  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  31.18 
 
 		 1058 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  32.78 
 
 		 1036 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  30.8 
 
 		 601 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 814 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  29 
 
 		 1100 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  32.92 
 
 		 591 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 973 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  28.57 
 
 		 777 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  31.1 
 
 		 1042 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 1064 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  26.63 
 
 		 921 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  29.09 
 
 		 780 aa  154  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  33.42 
 
 		 591 aa  154  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2158  ATPase-like  25.73 
 
 		 856 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 393 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  27.58 
 
 		 1044 aa  152  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  27.88 
 
 		 1018 aa  151  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 1001 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  28.42 
 
 		 961 aa  150  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  30.91 
 
 		 1058 aa  150  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  30.8 
 
 		 601 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  30.8 
 
 		 601 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  30.93 
 
 		 1072 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 1043 aa  147  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  34.1 
 
 		 1064 aa  147  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  28.38 
 
 		 1049 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  27.56 
 
 		 765 aa  146  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  29.62 
 
 		 1014 aa  145  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  28.6 
 
 		 827 aa  144  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 490 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  26.97 
 
 		 678 aa  142  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 973 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  29.3 
 
 		 618 aa  140  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  28.6 
 
 		 906 aa  140  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  25.71 
 
 		 840 aa  140  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>