More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1023 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  100 
 
 		 1104 aa  2159    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  36.44 
 
 		 996 aa  265  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  30.52 
 
 		 999 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  33.89 
 
 		 992 aa  229  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 1064 aa  223  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  33.14 
 
 		 1044 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 		 816 aa  217  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  29.83 
 
 		 991 aa  216  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 781 aa  210  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  39.27 
 
 		 1036 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  28.59 
 
 		 888 aa  209  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 799 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  31.1 
 
 		 1056 aa  205  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  28.92 
 
 		 975 aa  205  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 901 aa  205  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  30.95 
 
 		 1092 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  31.01 
 
 		 1087 aa  202  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 726 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 1082 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  32.11 
 
 		 840 aa  196  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 736 aa  195  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 775 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  35.99 
 
 		 1058 aa  192  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  31.83 
 
 		 1055 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  30.91 
 
 		 1103 aa  187  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  28.37 
 
 		 1100 aa  187  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  30.05 
 
 		 792 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 952 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  31.06 
 
 		 1085 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 882 aa  186  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 910 aa  182  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  29.75 
 
 		 1049 aa  181  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 1043 aa  181  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  28.62 
 
 		 1050 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 872 aa  180  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 768 aa  177  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  27.71 
 
 		 1125 aa  177  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  31.75 
 
 		 1102 aa  177  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  33.49 
 
 		 1058 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 814 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  31.37 
 
 		 886 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  30.05 
 
 		 969 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 729 aa  175  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  28.46 
 
 		 1227 aa  175  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 1110 aa  174  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  29.82 
 
 		 799 aa  172  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 1050 aa  172  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 1137 aa  171  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  28.98 
 
 		 1042 aa  171  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  26.87 
 
 		 824 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  32.62 
 
 		 1066 aa  169  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  37.05 
 
 		 916 aa  168  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.73 
 
 		 1017 aa  168  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  30.69 
 
 		 1093 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  32.52 
 
 		 960 aa  165  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  30.06 
 
 		 777 aa  164  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  31.22 
 
 		 1072 aa  164  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  28.52 
 
 		 701 aa  164  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 812 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  31.96 
 
 		 1119 aa  163  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 802 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  26.51 
 
 		 1097 aa  162  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 1158 aa  160  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  30.62 
 
 		 1060 aa  159  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  27.87 
 
 		 797 aa  159  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  28.39 
 
 		 1018 aa  158  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  31.03 
 
 		 957 aa  157  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 1085 aa  156  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  29.51 
 
 		 765 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2158  ATPase-like  27.38 
 
 		 856 aa  155  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 798 aa  155  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  28.6 
 
 		 1056 aa  154  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 887 aa  154  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 755 aa  151  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  26.92 
 
 		 776 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  28.61 
 
 		 972 aa  149  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  32.2 
 
 		 760 aa  148  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 831 aa  147  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  26.93 
 
 		 961 aa  147  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  28.96 
 
 		 780 aa  146  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  31.85 
 
 		 1094 aa  146  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 393 aa  145  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 928 aa  145  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  30.91 
 
 		 1131 aa  144  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 877 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  33.86 
 
 		 931 aa  143  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  29.81 
 
 		 921 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  34.53 
 
 		 919 aa  142  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  27.04 
 
 		 827 aa  141  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 1005 aa  140  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  28.59 
 
 		 840 aa  140  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  26.7 
 
 		 950 aa  139  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  33.07 
 
 		 601 aa  139  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  27.76 
 
 		 1010 aa  139  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  29.87 
 
 		 678 aa  139  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  28.5 
 
 		 1048 aa  138  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 938 aa  138  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  27.35 
 
 		 956 aa  138  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1062  transcriptional regulator, LuxR family  29.59 
 
 		 933 aa  138  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  28.54 
 
 		 1186 aa  138  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>