More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1892 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  44.67 
 
 		 950 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  100 
 
 		 972 aa  1937    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  43.27 
 
 		 921 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  40.53 
 
 		 1001 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  39.16 
 
 		 966 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  35.89 
 
 		 961 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 1010 aa  482  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 877 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  35.3 
 
 		 973 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 928 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 1014 aa  458  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  33.95 
 
 		 956 aa  429  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4035  transcriptional regulator, winged helix family  34.44 
 
 		 946 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  34.03 
 
 		 959 aa  423  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 973 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  34.42 
 
 		 973 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 948 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 948 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 950 aa  386  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  34.28 
 
 		 953 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  44.7 
 
 		 601 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  45.26 
 
 		 601 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  45.26 
 
 		 601 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 658 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  41.17 
 
 		 618 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  44 
 
 		 591 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  44.58 
 
 		 591 aa  354  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  32.56 
 
 		 906 aa  340  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 954 aa  327  7e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  32.64 
 
 		 901 aa  322  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  40.8 
 
 		 493 aa  312  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  39.92 
 
 		 493 aa  310  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  39.92 
 
 		 493 aa  310  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 1066 aa  283  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 922 aa  278  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36 
 
 		 1092 aa  276  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  37.61 
 
 		 999 aa  275  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  43.69 
 
 		 1125 aa  272  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  37.12 
 
 		 490 aa  271  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  43.04 
 
 		 502 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  37.58 
 
 		 481 aa  268  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 781 aa  267  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 468 aa  267  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  31.84 
 
 		 701 aa  261  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  41.24 
 
 		 1056 aa  261  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  40.77 
 
 		 1102 aa  260  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.23 
 
 		 1085 aa  259  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  42.28 
 
 		 1042 aa  258  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  44.33 
 
 		 1017 aa  258  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  39.95 
 
 		 792 aa  256  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  44.93 
 
 		 1050 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 1100 aa  253  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  41.67 
 
 		 1087 aa  253  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  43.1 
 
 		 824 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  40.9 
 
 		 887 aa  252  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  42.99 
 
 		 1110 aa  252  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  35.27 
 
 		 960 aa  251  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  43.68 
 
 		 1055 aa  248  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  41 
 
 		 1058 aa  248  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  39.96 
 
 		 1103 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  38.31 
 
 		 799 aa  241  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  38.37 
 
 		 957 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  32.85 
 
 		 975 aa  239  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 1085 aa  239  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 882 aa  239  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  39.2 
 
 		 1049 aa  238  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  38 
 
 		 1137 aa  238  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 814 aa  237  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  37.02 
 
 		 816 aa  237  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 886 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  43.35 
 
 		 1119 aa  235  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  40.5 
 
 		 1043 aa  233  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  40.55 
 
 		 916 aa  231  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 1097 aa  231  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  39.85 
 
 		 1227 aa  229  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  44.48 
 
 		 1093 aa  229  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  36.8 
 
 		 931 aa  226  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  41.04 
 
 		 1072 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 		 943 aa  223  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  37.04 
 
 		 1058 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 901 aa  219  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 888 aa  219  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 775 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 776 aa  215  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  41.39 
 
 		 765 aa  214  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  40.62 
 
 		 840 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  40.05 
 
 		 919 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  38.35 
 
 		 1036 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 1082 aa  211  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  37.27 
 
 		 760 aa  210  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  44.38 
 
 		 969 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 952 aa  208  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  36.16 
 
 		 779 aa  207  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.78 
 
 		 1094 aa  207  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 393 aa  207  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  34.24 
 
 		 768 aa  206  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 		 755 aa  206  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  43.41 
 
 		 818 aa  206  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  36.92 
 
 		 951 aa  202  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  43.9 
 
 		 1158 aa  202  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>