230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1855 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 831 aa  1706    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 910 aa  306  7e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 812 aa  275  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 901 aa  263  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  27.42 
 
 		 816 aa  261  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  29.64 
 
 		 999 aa  255  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 802 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  35.17 
 
 		 1042 aa  240  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 		 768 aa  239  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  28.88 
 
 		 975 aa  237  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  33.54 
 
 		 886 aa  233  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  31.4 
 
 		 916 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 781 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 1058 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  32.45 
 
 		 1066 aa  218  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  28.63 
 
 		 1097 aa  218  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  28.25 
 
 		 1092 aa  217  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  33.1 
 
 		 701 aa  217  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  35.51 
 
 		 1119 aa  217  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  32.55 
 
 		 1050 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  32.46 
 
 		 1227 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  29.01 
 
 		 1102 aa  213  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  27.61 
 
 		 799 aa  212  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 888 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  30.74 
 
 		 779 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  34 
 
 		 1087 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  25.66 
 
 		 824 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  32.82 
 
 		 1049 aa  205  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  33.56 
 
 		 755 aa  204  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  29.62 
 
 		 1055 aa  201  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  32.04 
 
 		 1125 aa  200  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 726 aa  200  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  32.41 
 
 		 1056 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 799 aa  198  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 1058 aa  197  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  30.57 
 
 		 840 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  31.6 
 
 		 776 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 952 aa  196  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 736 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 804 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  32.32 
 
 		 969 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 943 aa  194  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  30.49 
 
 		 792 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  33.87 
 
 		 1093 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  34.84 
 
 		 658 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 1036 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  28.87 
 
 		 1085 aa  188  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 798 aa  188  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  32.08 
 
 		 1100 aa  187  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 1137 aa  187  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  32.04 
 
 		 1017 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  29.68 
 
 		 960 aa  184  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  28.37 
 
 		 1103 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 1094 aa  183  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  30.2 
 
 		 678 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 882 aa  182  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  29.68 
 
 		 1060 aa  182  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  31.54 
 
 		 1056 aa  181  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  27.5 
 
 		 1018 aa  181  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  27.99 
 
 		 1072 aa  181  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  29.79 
 
 		 957 aa  180  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  29.25 
 
 		 827 aa  180  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 1085 aa  180  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 765 aa  180  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  32.46 
 
 		 1010 aa  180  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 1082 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 872 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 973 aa  177  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 818 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  32 
 
 		 948 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 973 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  32.5 
 
 		 1110 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  30.67 
 
 		 1131 aa  173  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  30.3 
 
 		 777 aa  172  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 948 aa  171  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  28.79 
 
 		 996 aa  171  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 878 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 490 aa  168  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 1001 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  33.42 
 
 		 1158 aa  168  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 887 aa  167  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  30.41 
 
 		 1005 aa  168  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  30.65 
 
 		 1141 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 814 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  29.03 
 
 		 950 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 966 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  30.36 
 
 		 943 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  30.95 
 
 		 956 aa  164  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  32.25 
 
 		 931 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 1043 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 980 aa  161  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  25.93 
 
 		 840 aa  160  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 393 aa  160  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  31.54 
 
 		 951 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  31.51 
 
 		 877 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 775 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  32.98 
 
 		 919 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 		 938 aa  159  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  30.79 
 
 		 1064 aa  157  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  30.52 
 
 		 1076 aa  157  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>