More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4693 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 943 aa  1809    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  34.26 
 
 		 960 aa  307  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  31.86 
 
 		 969 aa  293  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  34.58 
 
 		 957 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  35.89 
 
 		 1018 aa  267  8e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  33.86 
 
 		 952 aa  261  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  34.63 
 
 		 1092 aa  260  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 1058 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  34.28 
 
 		 1125 aa  251  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  35.07 
 
 		 1042 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 963 aa  247  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  37.48 
 
 		 1093 aa  247  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  32.87 
 
 		 1103 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 1100 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  33.84 
 
 		 1102 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  33.7 
 
 		 1087 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 1058 aa  245  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  34.94 
 
 		 1066 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  36.67 
 
 		 1072 aa  243  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  37.33 
 
 		 1110 aa  241  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  35.22 
 
 		 1005 aa  236  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  32.8 
 
 		 1056 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  35.17 
 
 		 1055 aa  234  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  35.31 
 
 		 1017 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  33.1 
 
 		 1050 aa  232  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 943 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  34.96 
 
 		 941 aa  228  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  35.21 
 
 		 1097 aa  223  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  35.24 
 
 		 1048 aa  222  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  34.42 
 
 		 1036 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  36.76 
 
 		 1028 aa  213  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  33.71 
 
 		 1158 aa  210  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  36.88 
 
 		 980 aa  205  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 1186 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  37.76 
 
 		 1085 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  35.83 
 
 		 1064 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  32.34 
 
 		 1043 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  32.12 
 
 		 1049 aa  197  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  35.15 
 
 		 922 aa  197  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  33.72 
 
 		 1060 aa  195  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 1137 aa  195  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 1082 aa  192  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  38.06 
 
 		 886 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 1094 aa  185  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  36.36 
 
 		 1119 aa  182  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 755 aa  180  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.87 
 
 		 999 aa  180  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 630 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  34.46 
 
 		 824 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1085 aa  176  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  30.76 
 
 		 840 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 950 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  35.35 
 
 		 1005 aa  174  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  31.35 
 
 		 1010 aa  174  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  29.75 
 
 		 792 aa  171  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 882 aa  170  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  33.79 
 
 		 961 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5104  transcriptional regulator, SARP family  29.8 
 
 		 994 aa  169  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 		 765 aa  168  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  32.69 
 
 		 1131 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  34.16 
 
 		 1227 aa  165  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  29.61 
 
 		 776 aa  166  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 781 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 831 aa  164  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  31.38 
 
 		 964 aa  164  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  32.44 
 
 		 1088 aa  164  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  32.86 
 
 		 701 aa  163  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.44 
 
 		 827 aa  162  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 775 aa  161  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 		 818 aa  161  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 887 aa  161  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  36.36 
 
 		 1000 aa  160  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  33.84 
 
 		 877 aa  160  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  29.61 
 
 		 995 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  30.79 
 
 		 630 aa  159  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 959 aa  159  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.69 
 
 		 966 aa  158  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 816 aa  158  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  29.82 
 
 		 967 aa  157  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  34.87 
 
 		 768 aa  157  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  37.18 
 
 		 931 aa  156  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  41.88 
 
 		 951 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  39.41 
 
 		 1025 aa  156  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 888 aa  156  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 779 aa  154  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 814 aa  154  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  33.26 
 
 		 760 aa  154  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 928 aa  154  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  38.4 
 
 		 919 aa  154  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  29.95 
 
 		 921 aa  152  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 1064 aa  152  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  31.75 
 
 		 919 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 393 aa  152  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  31.16 
 
 		 953 aa  151  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  34.32 
 
 		 780 aa  150  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  33.02 
 
 		 940 aa  150  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  32.78 
 
 		 1010 aa  149  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  30.36 
 
 		 956 aa  148  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  29.23 
 
 		 934 aa  148  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  36.16 
 
 		 921 aa  148  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>