More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_7016 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  100 
 
 
973 aa  1902    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  54.55 
 
 
973 aa  898    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1478  tetratricopeptide TPR_4  98.31 
 
 
472 aa  918    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911948  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  97.69 
 
 
502 aa  693    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  74.92 
 
 
948 aa  1347    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  98.46 
 
 
973 aa  1873    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  44.11 
 
 
1014 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  74 
 
 
948 aa  1332    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  36.36 
 
 
1001 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  34.52 
 
 
966 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  46.67 
 
 
618 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.18 
 
 
877 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  34.97 
 
 
1010 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  34.57 
 
 
972 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  32.63 
 
 
961 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  32.46 
 
 
950 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 
950 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  32.75 
 
 
959 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  44.7 
 
 
493 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  44.7 
 
 
493 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  44.33 
 
 
493 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  32.33 
 
 
921 aa  360  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  43.78 
 
 
601 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  43.61 
 
 
601 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  43.61 
 
 
601 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  48.28 
 
 
591 aa  343  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  43.53 
 
 
591 aa  342  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  34.48 
 
 
954 aa  342  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  45.61 
 
 
658 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  30.99 
 
 
956 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4035  transcriptional regulator, winged helix family  31.35 
 
 
946 aa  327  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  42.49 
 
 
481 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  41.94 
 
 
468 aa  302  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  30.88 
 
 
928 aa  300  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  32.79 
 
 
953 aa  286  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  32.28 
 
 
906 aa  280  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  36.74 
 
 
490 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  36.61 
 
 
922 aa  257  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  31.53 
 
 
901 aa  249  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  41.19 
 
 
1085 aa  235  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  39.11 
 
 
1092 aa  228  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  42.82 
 
 
1066 aa  224  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.89 
 
 
1017 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  43.09 
 
 
1060 aa  223  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 
1137 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  39.44 
 
 
1125 aa  223  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 
1093 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  39.78 
 
 
1087 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  41.64 
 
 
1056 aa  215  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 
1141 aa  214  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  42.21 
 
 
916 aa  214  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  32.37 
 
 
504 aa  213  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  36.6 
 
 
701 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  39.7 
 
 
887 aa  213  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  39.32 
 
 
824 aa  211  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  41.13 
 
 
886 aa  211  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  42.9 
 
 
1055 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
781 aa  209  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.89 
 
 
1058 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  37.43 
 
 
1050 aa  209  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
882 aa  208  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  42.82 
 
 
1094 aa  207  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  39.59 
 
 
760 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  37.85 
 
 
999 aa  206  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 
1042 aa  206  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  40.11 
 
 
1072 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  39.14 
 
 
1227 aa  205  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  38.27 
 
 
827 aa  204  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.98 
 
 
1102 aa  204  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  40.57 
 
 
1119 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  37.98 
 
 
1049 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  41.18 
 
 
1043 aa  201  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 
1058 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
775 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  41.79 
 
 
799 aa  199  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  38.34 
 
 
840 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  38.26 
 
 
1103 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
393 aa  197  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  38.77 
 
 
952 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  35.79 
 
 
1097 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  35.67 
 
 
816 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  30.1 
 
 
888 aa  194  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  36.69 
 
 
792 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  36.8 
 
 
776 aa  193  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  38.95 
 
 
957 aa  191  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 
1100 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  36.02 
 
 
960 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 
1100 aa  187  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  39.26 
 
 
1131 aa  187  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  40 
 
 
1064 aa  187  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  39.63 
 
 
980 aa  187  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  40.51 
 
 
969 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  40.92 
 
 
878 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  38.73 
 
 
755 aa  185  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 
818 aa  184  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 
831 aa  183  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  39.53 
 
 
943 aa  182  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  38.92 
 
 
765 aa  180  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  39.94 
 
 
1076 aa  178  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  40.12 
 
 
1049 aa  177  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>