More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2391 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  100 
 
 		 954 aa  1857    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  38.55 
 
 		 961 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  38.24 
 
 		 956 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4035  transcriptional regulator, winged helix family  35.98 
 
 		 946 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  36.9 
 
 		 959 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  34.28 
 
 		 950 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  34.1 
 
 		 973 aa  341  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  33.76 
 
 		 973 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  34.77 
 
 		 953 aa  327  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 973 aa  325  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 948 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 948 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 972 aa  319  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  31.55 
 
 		 921 aa  319  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 922 aa  311  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 928 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 1001 aa  303  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  34.73 
 
 		 906 aa  290  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  29.91 
 
 		 950 aa  289  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  31.62 
 
 		 1010 aa  289  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 966 aa  288  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 504 aa  273  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  32.62 
 
 		 901 aa  270  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  38.61 
 
 		 490 aa  264  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  30.18 
 
 		 1014 aa  257  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  36.8 
 
 		 658 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  32.45 
 
 		 877 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  37.59 
 
 		 618 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 591 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 493 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 493 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  39.2 
 
 		 493 aa  245  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  37.32 
 
 		 601 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 591 aa  240  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  37.32 
 
 		 601 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  37.32 
 
 		 601 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 468 aa  227  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 481 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 502 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  40.85 
 
 		 1227 aa  203  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  31.52 
 
 		 1085 aa  201  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.19 
 
 		 1125 aa  191  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  31.88 
 
 		 975 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  38.88 
 
 		 1072 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  40.26 
 
 		 1087 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  39.68 
 
 		 1056 aa  187  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  39.3 
 
 		 1102 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 1085 aa  187  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  30.99 
 
 		 824 aa  184  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  39.05 
 
 		 887 aa  184  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 943 aa  183  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 781 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  39.59 
 
 		 1066 aa  181  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.94 
 
 		 1055 aa  181  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 882 aa  181  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  32.17 
 
 		 1092 aa  180  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 957 aa  181  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  40.06 
 
 		 886 aa  180  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  36.39 
 
 		 827 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  36.44 
 
 		 1050 aa  177  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.33 
 
 		 999 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  30.77 
 
 		 701 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  35.16 
 
 		 840 aa  172  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 1137 aa  172  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  35.17 
 
 		 799 aa  171  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 765 aa  170  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  38.11 
 
 		 1093 aa  170  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  35.43 
 
 		 931 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.67 
 
 		 1017 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 775 aa  168  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 888 aa  167  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  40.21 
 
 		 951 aa  168  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  37.02 
 
 		 1058 aa  167  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  37.53 
 
 		 1049 aa  167  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  36.54 
 
 		 1042 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  40.27 
 
 		 919 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 1097 aa  165  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  35.86 
 
 		 1060 aa  165  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  29.64 
 
 		 792 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  35.92 
 
 		 818 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  26.69 
 
 		 816 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  37.12 
 
 		 776 aa  164  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.85 
 
 		 960 aa  164  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 901 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  35.91 
 
 		 1119 aa  162  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 1141 aa  162  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.32 
 
 		 1103 aa  160  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  34.33 
 
 		 760 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 1058 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 812 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.47 
 
 		 1036 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  36.16 
 
 		 755 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  38.83 
 
 		 952 aa  157  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  35.73 
 
 		 878 aa  156  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  34.35 
 
 		 969 aa  154  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 1100 aa  154  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  35.01 
 
 		 1110 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 941 aa  153  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  35.64 
 
 		 779 aa  149  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  35.81 
 
 		 980 aa  148  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>