More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1634 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 1058 aa  2040    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  46.18 
 
 		 1060 aa  697    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  50.85 
 
 		 1028 aa  759    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  50.47 
 
 		 1048 aa  825    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 1097 aa  551  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 1100 aa  541  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  40.24 
 
 		 1056 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  40.33 
 
 		 1066 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 1049 aa  522  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  41.35 
 
 		 1072 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 1093 aa  519  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  39.79 
 
 		 1043 aa  515  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  42.96 
 
 		 1087 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  41.66 
 
 		 1110 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 1042 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  41.69 
 
 		 1058 aa  499  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  37.94 
 
 		 1050 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  40.52 
 
 		 1036 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 1082 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.75 
 
 		 1125 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  39.12 
 
 		 1103 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  41.37 
 
 		 1094 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  39.61 
 
 		 1092 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.2 
 
 		 1055 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.13 
 
 		 1017 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.73 
 
 		 1102 aa  399  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  39.97 
 
 		 1158 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  40.23 
 
 		 952 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.05 
 
 		 957 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 1005 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  40.3 
 
 		 960 aa  346  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  38.35 
 
 		 922 aa  337  7e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 969 aa  335  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  36.77 
 
 		 1018 aa  306  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 1186 aa  302  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.41 
 
 		 943 aa  293  9e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  38.44 
 
 		 1005 aa  288  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 1227 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 775 aa  279  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  37.87 
 
 		 963 aa  275  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  42.33 
 
 		 792 aa  274  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  43.74 
 
 		 781 aa  272  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  37.2 
 
 		 1076 aa  271  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  41.9 
 
 		 701 aa  269  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 943 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  38.34 
 
 		 980 aa  268  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  37.58 
 
 		 1049 aa  268  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  38.11 
 
 		 941 aa  267  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.52 
 
 		 999 aa  261  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 1034 aa  261  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  34.91 
 
 		 1131 aa  261  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.87 
 
 		 1085 aa  260  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  33.78 
 
 		 824 aa  260  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  30.3 
 
 		 1064 aa  258  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  42.62 
 
 		 1119 aa  256  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  37.28 
 
 		 1161 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  36.81 
 
 		 816 aa  242  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 1079 aa  238  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  40.43 
 
 		 886 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  34.73 
 
 		 1060 aa  234  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 765 aa  234  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  35.92 
 
 		 1100 aa  232  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  38 
 
 		 1085 aa  231  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  38.16 
 
 		 760 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  42.05 
 
 		 887 aa  230  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  38.14 
 
 		 777 aa  230  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.52 
 
 		 916 aa  227  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 882 aa  227  9e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  40.05 
 
 		 1137 aa  226  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  39.6 
 
 		 799 aa  225  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  38.89 
 
 		 840 aa  224  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  37.67 
 
 		 776 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  41.84 
 
 		 601 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  38.75 
 
 		 877 aa  218  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  37.35 
 
 		 1141 aa  218  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  36.34 
 
 		 827 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  41.06 
 
 		 973 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  37.64 
 
 		 972 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 393 aa  213  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  37.95 
 
 		 818 aa  213  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 922 aa  211  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  39.84 
 
 		 490 aa  210  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  41.84 
 
 		 601 aa  210  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  41.84 
 
 		 601 aa  210  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 755 aa  209  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 966 aa  209  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01160  predicted ATPase  32.76 
 
 		 892 aa  209  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  39.89 
 
 		 973 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  36.86 
 
 		 950 aa  207  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  39.38 
 
 		 1001 aa  206  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  39.84 
 
 		 948 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  41.83 
 
 		 591 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  33 
 
 		 1064 aa  205  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  40.56 
 
 		 948 aa  204  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  31.15 
 
 		 921 aa  204  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  39.89 
 
 		 973 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  40.97 
 
 		 591 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  37.53 
 
 		 780 aa  202  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  37.67 
 
 		 618 aa  201  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 901 aa  201  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>